目前对EGSB反应器的研究和应用还比较有限。虽然EGSB反应器拥有众多的UASB反应器不具备的优点，但由于反应器结构和设计思想的不同，以及微生物只能在一定的温度范同内生长、发育、繁殖、分解，当低于某个温度时，微生物就失去活性，处于被抑制状态等原因。EGSB反应器在其应用的领域、操作技术、污泥特性及机理方面还存在较多完善的地方。

（1）颗粒污泥的培养问题

不同温度下EGSB反应器启动而临的首要问题是种泥的选择。颗粒污泥、厌氧消化污泥、牛粪和下水道污泥均可作为EGSB反应器的种泥。处理某一温度下废水的接种污泥，最佳选择是选择这一温度下EGSB反应器的颗粒污沈，因为在经过短的启动期后，EGSB反应器即能获得理想的运行效果。但现在，在许多国家获取能用于启动大型EGSB反应器处理相似废水的状氧颗粒污泥是非常困难的，甚至是不可能的，购买和运输的费用也较高。而接种处理不同废水的颗粒污泥需很长一段时间的适应期。因此，需要考虑选择其他种泥来启动EGSB反虚器。一般来讲，市政消化污泥不仅是最易获取的，而且也是较适宜的接种污泥。市政消化污泥不仅具有较高的产甲烷活性，而且也具有复杂的微生物生态系统，适于处理多种废水。

但接种市政消化污泥时，由于厌氧菌生长缓慢（尤其是产甲烷菌），反应器启动期很长，一般需要60～240h才能正常运行。因此，形成高活性、稳定的颗粒污泥所需的较长的启动期仍是EGSB反应器所面临的一个主要问题，这也正是限制其实际应用的关键因素。因而对于污水厌氧生物处理工业来说，迫切需要寻求不同温度下厌氧颗粒污泥的大量、快速培养技术。

（2）EGSB反应器的启动

与其他厌氧工艺一样，EGSB反应器处理装置的启动时间长。其投产测试时间要比好氧工艺长得多，有时甚至需要1年的时间，这是因为厌氧微生物合成新细胞所需有机物的数量比好氧微生物要多，繁殖周期也比后者长。在18～30℃条件下，好氧菌世代时间为20～30min；而大部分厌氧菌的世代时间为5d，甚至更长一些。

EGSB反应器能否在不同温度下稳定、高效地运行，在很大程度上取决于反应器内的污泥性能。好的污泥应该具有良好的沉淀性和高产甲烷活性，并且应呈颗粒状。为此，EGSB反应器的启动越来越受到研究者和工程者的重视。

（3）对难降解有毒物质的高效降解

采用厌氧技术处理不同温度的工业废水已成趋势，但由于许多工业废水中有一些难降解、有毒或可通过各种方式影响生物处理系统的物质，最终造成系统处理效率低甚至失败。已有许多有关厌氧、好氧生物技术能降解多种毒性和难降解物质的报道，但有一点值得注意，毒性物质的消失并不意味着这些物质完令转化为无毒物质或矿化。有可能这些物质仅被转化为一些中间产物，而且在某些情况下，这些中间产物比原来的物质具有更大毒性，更难降解。这已在高氯乙烯、五氯苯酚、多氯联苯等物质在中温条件下的降解过程中得到证实。

中温条件下，当废水中含有对微生物有毒害作用的物质或是难于生物降解的物质时，采用UASB反应器都很难获得较好的效果。由丁EGSB反应器具有很高的出水循环比率，它可以将原水中毒性物质的浓度稀释到微生物可以承受的程度，从而保证反应器中的微生物能良好生长；同时反应器中液体上升流速大，废水与微生物之间能够充分接触，可以促进微生物降解能力。因此，采用EGSB反应器处理毒性或难降解的废水可以获得较好的效果。

厌氧——好氧技术已被人们普遍接受并用于工业废水的处理，以降解有毒性、难降解物质。但由于这些物质的厌氧转化常常是不完全的，而且厌氧代谢中间产物的积累也会对产生甲烷菌产生抑制，从而造成厌氧处理效率降低，以致增加后续好氧处理系统的负荷。最终使整个系统处理效率降低。在EGSB反应器中创造好氧菌与厌氧菌共存、氧化与还原作用同时发生的环境能够将一些难降解的毒性物质有效降解，使多种污染物可同时作为基质被微生物利用，降低毒性中间代谢的聚集。这样不但可以用一个反应器代替原来的两个反应器，减少投资，而且微生物的多样性和代谢物的及时交换使处理系统更加稳定 。