根据对新品种选育过程中对花色变化、花型变化以及品种形成等问题的长期观察和研究，“花色”、“花型”、“品种名称”三级分方法，符合牡丹品种演化的实际过程。

花色是牡丹最突出、最容易判别的特征，而且花色比较稳定，所以将花色作为紫斑牡丹品种分类的第一等级。花色分为白、粉、红、紫、黑、蓝、黄和复色共9种类型。其中黑色指深紫色和墨紫色，黄色指淡黄色或浅黄色，蓝色指粉蓝色或粉紫蓝色，复色指具有两种或两种以上的颜色。

花型是正确反映品种特点和观赏价值的主要特征，是盘中开花时花朵整体形态特征的综合体现，从单瓣、半重瓣到重瓣，反映了花瓣不断增多和随之发生的外观形态变化。紫斑牡丹花型可分为单瓣型、荷花型、菊花型、蔷薇型、托桂型、皇冠型、绣球型。

品种名称是品种分类最低等级和基本单元，代表着具有生产应用价值和理论研究价值的具体植株，是所有信息的总会，其内容以品种名称第一次合法发表时的描述为准。

颜色分类

中国全国各地不同花色（如：红、紫、紫红、粉、白、蓝、绿、黄、黑和复色等）、不同花型（如：单瓣型、荷花型、皇冠型、楼子型、绣球型等）和具有抗旱、耐寒、耐热、耐湿等特性，可以种植在温带、寒热和亚热带地区的品种300多个，还有日本、美国、法国品种100余个。

（一）复色类

什样锦、娇容三变、斗艳、二乔三变赛玉、玛瑙荷花、彩蝶、花蝴蝶

（二）绿色类

绿香球、春水绿波、豆绿、绿玉

（三）黄色类

姚黄、金桂飘香、玉玺映月、黄花葵、金玉交章、御衣黄

（四）墨紫色类

冠世墨玉、烟绒紫、青龙卧墨池、墨楼争辉、乌金耀辉、黑花魁。

（五）粉色类

赵粉、鲁粉、粉中冠、桃花飞雪 、贵妃插翠、雪映桃花、软玉温香、淑女妆、粉荷飘江、银鳞碧珠、盛丹炉、青龙卧粉池

（六）白色类

夜光白、景玉、香玉、金星雪浪、琉璃冠珠、雪塔、白玉、雪桂、昆山夜光、玉楼点翠、玉板白、雪莲、水晶白、白鹤羽、风丹白、水晶球、风丹白、玉板白、清香白

（七）粉蓝（紫）色类

蓝田玉、 紫蓝魁、蓝宝石、菱花湛露、垂头蓝、朱砂垒、绣桃花、雨后风光 、彩绘 、大朵蓝 、似荷莲 、蓝芙蓉、鲁菏红

（八）紫色类

胜葛巾、魏紫、赵紫、葛巾紫、小魏紫、紫魁、深黑紫

（九）紫红色类

红霞争辉、红霞迎日、锦袍红、乌龙捧盛、藏枝红、百园红霞、映金红、大棕紫、首案红、状元红、盘中取果、锦绣球、洛阳红

（十）红色类珊瑚台、丛中笑、晨红、火炼金丹、娇红、萍实艳、锦帐芙蓉、迎日红、十八号、霓虹焕彩、红宝石、宏图、山花烂漫、脂红、明星、春红娇艳、肉芙蓉、虞姬艳装、飞燕红装、银红巧对、胡红、红珠女、璎珞宝珠。