办公室、人事（党办）科、规划计划科、财务经济管理与审计科、安全生产监督管理科、资阳市节约用水办公室（水政监察支队）、水政水资源科、河道管理科、水利电力建设管理科、水土保持科、农村水利科、水利水电工程移民办公室。
（一）办公室
负责综合协调、督查督办、目标绩效管理、文电：会务、机要、档案等机关日常运转工作；承担信息、保密、信访、维稳、政务公开、新闻发布工作。牵头办理人大代表建议、政协委员提案；负责重大会议和重要接待工作；组织编写市水务志和行业大事记，负责局机关内部规章制度建设。
（二）规划计划科
负责拟订全市水务发展战略和中长期规划；负责组织编制有关水务方面的综合规划和专业规划，并组织实施。承担全市大中型水利工程建设项目建议书、可行性研究报告和初步设计，指导水利工程建设项目合规性审查工作；协调水域、流域或区域综合规划和专项规划，协调水域、流域开发工作；承办水务行业综合统计工作。
（三）水政水资源科（资阳市人民政府节约用水办公室）
拟订全市水务管理的实施细则和管理办法，并组织实施；负责全市水政监察规范化建设和管理，协调并仲裁部门之间、地区之间的水事纠纷；承办水行政应诉、行政复议、行政赔偿和普法教育工作；负责政策调研工作；负责全市水资源的统一管理工作；组织开展水资源调查评价工作，负责跨行政区域水资源调度，组织实施取水许可、水资源有偿使用和水资源论证制度；组织编制水资源保护规划，组织水功能区的划分并监督实施，核定水域纳污能力，提出限制排污总量建议，指导饮用水水源保护工作，指导地下水开发利用和城市规划区地下水资源管理保护工作。发布水资源公报，协调水文工作。拟订节约用水发展规划和年度计划，并组织实施。组织制定节约用水政策和技术质量标准、规程、规范；负责节约用水的管理与监督；组织参与重大节水项目的设计审查与验收。
（四）建设管理科（河道管理科）
负责全市水务工程基本建设项目的建设与管理，承办大中型水利项目的初审转报工作，组织具有控制性或跨县（市、区）的重点水利工程项目建设、管理和验收；组织指导河道、水库、湖泊（包括人工水道、行洪区、蓄水区、滞洪区）、河口滩涂的治理和开发；负责按供水、排水等技术质量标准和工程施工的规程、规范的监督实施；负责市管江河的“三线”划定和清障工作；负责江河沿岸和跨（穿）江河建设项目评估审查；负责对水利建设工程项目的招投标活动的监督执法；负责河道管理范围内的采砂管理工作。
（五）农村水利水保科
组织拟订全市农村水利的发展规划及大中型灌区规划；指导农田水利基本建设、农村水利社会化服务体系建设；组织、指导农村饮水安全、乡镇集中供水、节水灌溉、排水等工程建设与管理工作，组织、指导已建成水利工程的运行管理和除险加固工作，承担水土流失综合防治工作；组织编制水土保持规划并监督实施；组织水土流失监测工作；审核开发建设项目水土保持方案并监督实施。
（六）供排水管理科
负责全市供水、排水、污水处理、再生水利用的行业管理工
作。编制全市供水、排水、污水处理、再生水利用的发展规划和年度计划并组织实施，组织制定全市供水行业的质量技术、运营服务等管理标准，并监督实施；指导、监督全市供水行业的服务质量和安全生产工作；’负责城市的排水许可和排水接管的行政监督管理，负责城区道路排涝调度指挥工作，负责协调城市建设中的供水管网、排水、污水处理、再生水利用的管线改、扩、建工作；负责城市排水、污水处理、再生水利用、基础设施使用和安全监督检查。
（七）安全监督科
承担水务行业安全生产工作，组织指导水库、水电站大坝。
渔业船舶、水利工程质量和安全监管，指导行业安全事故的调查
处理。
（八）行政审批科
负责拟订行政审批、行政许可事项审查（审核）的规程细则；制定机关行政审批、行政许可和公共服务事项办理制度并组织实施，~依法受理并办理行政审批、行政许可和公共服务事项手指导全市水务行政部门行政审批工作。
（九）财务科
负责编制全市水务行业财务中长期规划和年度计划，组织实施财务、会计和专项经费的综合管理。拟订水利行业的经济调节措施并组织实施，负责对水利行业各类专项资金及费用的征收、使用、调度与衔接；研究提出有关水务的价格、收费、信贷的建议；负责全市水务系统国有资产的监督管理。负责对局直属单位的经济活动、经济责任、财务收支、国有资产的审计监督，开展水利行业内部审计工作。
（十）人事科
负责机关和直属单位的机构编制、人事管理、劳动工资工作；会同有关部门组织水务行业墩育培训工作；负责水务体制改革的有关工作；指导水务行业职工队伍和服务体系建设；负责水利行业劳动保护工作；承办有关知识产权事宜；负责对外经济、技术合作与交流等事务；负责机关离退休人员工作，指导直属单位离退休人员工作。
机关党组织按有关规定设置。
四川省都江堰灌区毗河供水工程筹建组资阳市筹建办公室、资阳市堤防工程管理处、四川省水土保持生态环境监测分站（资阳市水保处、资阳市水土保持监督处）、资阳市人民政府防汛抗旱指挥部防汛办公室、资阳市水利工程管理处、资阳市抗旱服务支队、资阳市水利工程质量监督站、四川渔业船舶检验局资阳检验处。
资阳市水产渔政局（独立核算的二级事业单位）。
