实验室目前固定人员79人，其中研究人员76人，技术人员3人。主要由中青年研究人员构成，35岁以下27人，35-40岁15人，40-45岁12人，45-50岁10人，50岁以上15人。固定人员中教授32人，副教授30人，讲师14人，高级工程师1人，助理工程师2人。其中博士生导师29人，硕士生导师30人。
实验室流动人员20人，其中博士后人员6名，客座研究人员14名。客座研究人员来自国外的加拿大国家水文中心、美国俄亥俄州立大学、意大利威尼斯大学、美国农业部农业研究局北美平原农业研究实验室、美国新墨西哥州立大学、澳大利亚联邦科工委组织水土中心、英国牛津大学和国内的中科院西北生态资源环境研究院、青藏高原研究所、新疆生态与地理研究所等单位。
