作为新中国成立以来广东省单项投资最大的水利工程，也是第一批引进社会资本参与重大水利工程建设运营的试点项目之一，高陂水利枢纽工程投资来源为中央资金、省级资金及社会资金三部分。目前，三位一体的投资模式正在稳步推进。
据省水利厅相关负责人介绍，该工程总投资约61.5亿元，中央预算内投资补贴30.1450亿元，占比约五成，“这是我省水利项目有史以来争取中央预算内补助数额最多、补助比例最大的项目。”该负责人指出，中央大力投入该枢纽工程建设，是源于国务院将其列入全国172项节水供水重大水利工程中今年拟开工建设的27项工程之一，以及《国务院关于支持赣南等原中央苏区振兴发展的若干意见》的重点建设项目。更早之前，高陂水利枢纽工程还被列入省水利建设“十二五”规划重点工程及国家水利部以发展民生水利、保障国家水安全为重点的重大水利项目，“也就是说，国家和省治理大江大河，以及振兴苏区发展的方向上，该工程都被纳入重点。
