洋桔梗主要病害有茎枯病、根腐病、灰斑病等。茎枯病系真菌侵染，主要危害植株茎部，发病时，洋桔梗茎部皮层组织腐烂。高温高湿环境容易导致该病发生。发病初期喷施1%的波尔多液，严重时可用50%甲基托布津可湿性粉剂500倍液和50%百草清可湿性粉剂500-800倍液交替使用，每3-5天喷洒一次。另外注意加强通风透光；降低植株种植密度；合理施氮肥，适当增加磷钾肥，提高植株抗病能力。
根腐病也是一种真菌病害，主要侵染根部及根茎部，发病时根茎部形成黑色坏死斑，严重时植株枯死。该真菌传播主要靠土壤、肥料、浇水等。防治方法：施用腐熟的肥料；浇水适当，避免积水；发病初期可用50%的多菌灵可湿性粉剂600倍液，每隔10天左右喷施一次，连续2-3次。
主要虫害有潜叶蝇和蚜虫，可用BT生物制剂杀死，蚜虫防治也可用50%辛硫磷1000倍液或40%氧化乐果乳油1000-1500倍液进行喷洒。
