根据2001年机构改革“三定”方案，温州市市级机关事务管理局的主要职责是：

（一）研究制订市级机关行政事务工作的具体政策和规章制度，并组织实施；会同有关部门研究制订并组织实施市级机关后勤体制改革的政策和办法；宏观管理、指导市级机关后勤服务单位开展业务，推动机关后勤服务单位的改革和发展。

（二）负责市级机关房地产产权、产籍和使用的综合管理，制订有关管理规章制度，并组织实施；负责市级机关办公用房（包括行政中心）的建设、分配、调整和维修管理；协助有关部门做好部分机关工作人员住房制度改革工作。

（三）负责市级机关行政单位汽车配备、更新计划的事前审核和调剂使用的管理工作。

（四）负责机关大院（行政中心）绿化、房屋修缮、大宗印刷、会议接待、汽车燃料与维修等项目的招标工作，协助有关部门管理机关大院（行政中心）办公设备和用品的政府采购招标工作。

（五）负责机关大院（行政中心）的安全保卫工作；负责机关大院后勤保障和服务工作；指导和协调市级机关绿化等工作。

（六）负责市委、市政府召开的重要会议的会务工作。

（七）负责市级领导（含离退休）及市委、市政府指定的领导同志的有关生活服务。

（八）负责局属单位国有资产、财务制度执行情况的监督和管理。

（九）承办市委、市政府领导交办的其他事项。