在史书上的区分
金刚经上就有类似的记载。在中国所有的佛经中，佛家七宝的前五类是公认的，即金、银、琉璃、砗磲*一种软体动物*玛瑙，后两类有说是水晶的，有说是琥珀、玻璃的，不一而足，这说明琉璃是公认的佛家宝物；琉璃与水晶及玻璃截然不同。
化学成分不同
天然水晶、琉璃、玻璃的主要成分都是二氧化硅。当代国家级的权威专著《中国古琉璃研究》记载：古埃及“费昂斯”（也就是西方水晶玻璃的始祖）二氧化硅的比例92%（不通透）-99%，中国周朝时的琉璃，二氧化硅的比例仅仅是略大于90%（通透）。这9%的区别就是琉璃与水晶最大的不同。
成份详解
古代的琉璃是用琉璃石加入琉璃母烧制而成的，琉璃石是一种有色水晶材料，的主要成份应该以二氧化硅为主，琉璃母则是一种采自天然又经人工炼制后的古法配方，可以改变水晶的结构与物理特性，在造型、色彩与通透度上有明显的不同。
明代的药玉应该是琉璃母的配方上有一些不同，所以明代的药玉色彩少变化，也不通透。
琉璃的等级实际上取决于琉璃母的原料与配制方法，这是自古以来的不传之秘，正是因为琉璃母的存在，才使中国古法琉璃与水晶乃至西方的水晶玻璃“费昂斯”在成份上有了9%的不同。
水琉璃是以透明树脂胶加颜料浇制而成的树脂制品，其特点是成本低、技术含量低、工艺简单、易于批量生产，与琉璃的区别主要在：
1、树脂折射率低而致产品的质感不同，水琉璃缺乏铅水晶玻璃的晶莹感。
2、重量区别，水琉璃的重量约为琉璃的30%。
3、水琉璃易老化，颜色不稳定。
“水琉璃”的识别特征
“水琉璃”的材质是树脂、水晶胶等化工原料，类同于透明塑料，其特点是：
A、色泽：明显的化工色素，同塑料制品。
B、密度：等同于塑料，远远轻于真正的琉璃，商家常将水琉璃与大量的金属附件组合在一起，以其在重量上造成混淆，更有一些不良商家为蒙骗消费者，常在水琉璃制品底部，暗藏铅块等重物，以造成“真琉璃”的假象，消费者只需仔细辨别即可识破。
C、声音：与塑料制品相同。
D、透明度：明显浑浊，不通透
E、保存时间：一至两年后即开始褪色，通透感日差。通俗地说：时间越长，就越象塑料。
古法琉璃的识别特征：
A、色泽：水晶和玻璃都有不同的色彩，但全部以纯色为主，混合后会爆裂或者混浊。唯有古法琉璃可以有多种颜色混成，且通透如故。
B、密度：古法琉璃的密度明显高于玻璃，略高于水晶，且手感滑润。
C、声音：轻轻敲击古法琉璃会有金属之音。
D、透明度：界于玻璃和水晶之间，偶有烧制流动过程产生的少量气泡。
E、保存时间：无限期，从材质角度看，古法琉璃永不变色，今天从汉王刘胜墓中出土的古法琉璃耳杯依然色泽如新，剔透如故。
