磷酸核糖焦磷酸是重要的代谢中间物，参与嘌呤核苷酸与嘧啶核苷酸的从头合成和补救合成、某些核苷酸类辅酶如辅酶I和辅酶II、以及某些氨基酸如组氨酸和色氨酸的合成。其在细胞内的浓度受到严格调控，且浓度一般较低。
磷酸核糖焦磷酸负责在下列反应中作为磷酸核糖基团的供体：
| 酶 |
底物 |
产物 |
|---|---|---|
| 腺嘌呤磷酸核糖转移酶 |
腺嘌呤 |
AMP |
| 次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶 |
鸟嘌呤 |
GMP |
| 次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶 |
次黄嘌呤 |
IMP |
| 乳清酸磷酸核糖转移酶 |
乳清酸 |
OMP |
| 尿嘧啶磷酸核糖转移酶 |
尿嘧啶 |
UMP |
在嘌呤核苷酸的从头合成中，磷酸核糖焦磷酸受到谷氨酰胺：磷酸核糖焦磷酸氨基转移酶的催化，转变为磷酸核糖胺。2100433B
