种子蕨是在泥盆纪晚期，从裸子植物群中演化出的一种乔木状植物。因为这种乔木状的植物有种子，所以被称为种子蕨。

种子蕨类的植物体一般不大，大多数是倚生或攀援的籐本型。也有一部分呈直立的树蕨状，不分枝，高可达10米，或为直立粗壮的小乔木。绝大多数种子蕨植物具真蕨植物一样的大型蕨叶(多为羽状复叶)及脉序，不同的是在生殖蕨型叶上长有种子和花粉囊，蕨叶的主叶柄常二歧分叉，叶子表面的角质层厚。茎和根的解剖结构既具真蕨纲性状又具裸子植物性状，原生中柱，真式中柱或多体中柱。有髓的茎中髓常较大，皮部粗厚而次生维管组织较薄，次生木质部疏木型，它们与苏铁纲的解剖结构最相似，在未曾发现种子前，曾名之为苏铁羊齿或苏铁蕨(Cycadofilices)。 少数类别次生木质部密木型。 花粉囊和胚珠的形式多样。胚珠具离生珠被。胚珠的结构与苏铁纲的种子相似，本纲至今仅发现二例种子中具胚而绝大多数是保存具颈卵器之雌配子体，因此，所谓种子实际上大都是未受精的胚珠。