（一）办公室

组织协调局机关日常工作；负责局机关文电、会务、机要、档案、信息、保密、信访、督查、综合性文稿起草和后勤服务保障等工作；负责政务公开、新闻发布、宣传工作；负责人大、政协提案办理工作；负责开展调查研究，掌握全市水利与渔业工作动态；负责机关规范化建设、节能型机关建设；负责局机关并指导所属单位的计划生育工作。

（二）人事政工科

负责局机关和所属单位的人事管理、机构编制工作，承办局管干部的管理；负责纪检监察、精神文明建设、职工教育培训和人才队伍建设工作；负责水利、渔业体制改革的有关工作；编制全市水利与渔业科学技术和教育发展规划，组织水利与渔业对外交流合作、引进国（境）外智力工作；组织重大水利科研项目立项、攻关、成果鉴定及技术推广工作；承办局机关并指导所属单位的党、群（工、青、妇）工作；负责局机关并指导所属单位离退休人员管理服务工作。

（三）计划财务科

组织编制全市水利与渔业发展战略、中长期规划和年度计划；承办重点水利建设项目建议书和可行性报告的编制、审查工作；组织编制流域综合规划和专项计划，协调流域开发工作；编制市级水利部门预决算，提出水利建设投资规模、方向和项目安排建议；承担市级水利、渔业资金和国有资产的监督管理工作；协调有关水利与渔业的价格、收费、信贷、税收事宜；负责局机关并指导所属单位的财务管理工作；负责全市水利与渔业综合统计分析工作。

（四）政策法规科（挂市水政监察支队牌子）

负责拟订全市水利与渔业法制建设规划和有关政策；指导水政、渔政监察队伍建设、行政执法以及水利与渔业行政事业性收费征收管理工作；负责水政、渔政管理、监察和案件查处工作，协调处理市（地）际间、部门间和区际间的水事、渔事纠纷；指导水利、渔业行政许可和普法宣传工作；承办相关行政应诉、行政复议和行政赔偿工作；负责局机关并指导所属单位的社会治安综合治理工作；负责局机关安全保卫工作。