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由于F—与OH—在地球化学性质上很相近，因此在表生作用过程中，常与羟基一起在各种粘土矿物中集中，导致与氯发生分离。因此由成熟度高的沉积岩形成的改造型花岗岩及其有关的热液中，常有氟的富集。
在各种岩石中，最常见的和最易发生萤石化的岩石是改造型花岗岩及其附近的灰岩；在与改造型花岗岩有成因联系的流纹岩等酸性火山岩系中，易形成萤石矿脉，脉旁的萤石化也较常见，但分布范围较窄。
