生于海拔1000-2500米的荒漠区。 裸果木适生的分布区具有干旱、多风、夏季酷热，冬季寒冷，昼夜温差较大的大陆性气候。年平均温6-12℃，极端最高温34.3-43.9℃，地表温度高达60℃以上，极端最低温-20℃，年降水量36.9-200毫米，年蒸发量300-3378毫米，八级以上大风日常达20-30天。由于裸果木植株矮小。根系发达，枝干木质化程度高，十分坚硬。喜光性强，耐干旱、寒冷和瘠薄土壤，抗风能力强，多生在干旱的灰棕色荒漠土或棕色荒漠土的砾石戈壁或低矮的剥蚀残丘下部，在地表径流或低洼处常形成单优势种群落。
