列入中国《国家重点保护野生植物名录》——一级。 列入《世界自然保护联盟濒危物种红色名录》（IUCN）——濒危（EN）。列入《全国极小种群野生植物拯救保护工程规划》（2011－2015年）。
列入《国家重点保护野生植物》——Ⅰ级，被植物学家称为“植物熊猫”的银杉，是三百万年前第四纪冰川后残留下来的稀世珍宝。湖南省城步苗族自治县保险公司为银杉办了火灾保险。在城步县沙舟洞银杉保护区，生长着58株枝壮叶茂的银杉树，其数量之多在国内外均属罕见。尽管这些“国宝”已列为国家一级树种，受到格外的珍惜和保护， 但由于银杉喜阴不喜阳，总是生长在茂密的原始森林地带，因此随时都受到森林火灾的威胁，林业研究工作者对此十分但心。为了“国宝”长存，为了银杉永世，城步县保险公司在林业部门的积极支持和密切配合下，对这片保护区进行了可行性调查，制订了有关的保险条款和相应的保险防灾措施，稳妥地为58株银杉办了火灾保险。
各地发现银杉之后，地方政府和有关单位都很重视，并采取了一些保护措施。已在广西花坪和重庆金佛山建立了以保护银杉为主的自然保护区，开展了银杉的繁殖试验和引种工作。为了促进银杉的天然更新和扩大分布范围，建议在只有单株银杉生长，林分郁闭度较大、林下有幼树的分布点上，适当择伐部分生长较快的上层林木；或在有银杉生长的山脊两侧，择伐一些林木，以利银杉幼苗、幼树的生长。
花坪保护区是一片群山巍巍、林海浩瀚的原始林区，主峰蔚青岭海拔1895米。年平均气温12-14℃。该地区是一个博大奥秘的植物宝库，它随着海拔差异，以及河谷、山地地形气候的不同，出现有亚热带常绿阔叶林、落叶阔叶林、针叶林、温带植物，以及互相交混的植被类型。植物种类繁多，仅高等植物就有1000多种。最为珍稀的是银杉，植物学界曾认为，冰川时代曾经生长在地球上的银杉植物。花坪的岩层多为砂页岩，断裂发育，山势陡峭。
地处重庆南川区境内的国家级风景名胜区金佛山上，生长着一种古老的孑遗植物——银杉。金佛山现有银杉1978株，最高的一株高16米，胸径53厘米。银杉喜欢气温低、云雾多、湿度大、雨量足、日照少的高山气候。银杉生长在海拔1300米至1800米的地区。金佛山能保存下来众多的银杉，是因为在距今二百五十万年的第四纪，大陆冰川覆盖大部分北半球地区，使第三纪和第四纪以前的茂密森林大量灭绝。而金佛山地处渝黔交界，北面是秦岭，南面是大娄山，一座座山峰高耸，像一道道巨大的屏障，阻挡了冰川的袭击，加之河谷地区受季风气候影响，冰川活动被限制在局部地区，植物群没有遭到“全军覆灭”的厄运，银杉才能得以保存下来。
来宾金秀银杉公园为中国银杉分布的最南点，其中有一株银杉胸径86.9厘米，树高30.65米，树龄已逾50年，号称银杉王。公园内有10株银杉，与华南五针松、牛皮杜鹃等众多的珍贵树种组成的混交林。
