物理清洗是指用人工或机械方法从膜面上或膜孔内去除污染物，主要采用水或气进行冲洗的方法。冲洗时应在低压下进行，以免对膜造成损伤。包括正向冲洗、变向冲洗、振动、排气冲水法、空气喷射和循环洗涤等多种方法。
使用化学清洗剂必须与膜材料相容，并严格按膜生产提出的条件（压力、温度和流速等）进行清洗，以防膜生产不可逆的损伤
电清洗就是在膜上施加电场使带电粒子或分子沿电场方向移动，在一定时间隔内施加电场且无须中断操作就可除去界面上的粒子或分子。这种方法存在的缺点是需要用导电膜和安装有电极和特殊膜器。
无论用这三种哪种方法进行膜清洗都会对膜造成伤害，因此、为了提高清洗质量超声波清洗成了最好的选择。
