测绘科技信息中心下设 网络技术部、图书馆与测绘情报部、期刊编辑部、宣传通讯部、测绘成果质量检验部、GIS软件测评部，以及中国测绘学会信息网分会办公室等7个业务部门。

网络技术部　负责院科研装备的规划，设备购置，计算机系统、计算机网络（包括内部局域网和国际互联网络）的建设、管理和维护工作，以及对外承揽网络工程项目。

图书馆与测绘情报部　负责测绘科技信息资源库（图书馆、数据库）的建设，测绘科技及测绘事业发展战略情报研究，提供测绘科技信息检索、查新服务，以及院各类档案的存储、管理和服务工作。

期刊编辑部　负责《测绘科学》、《遥感信息》和《测绘文摘》三个测绘科技期刊的编辑、出版和发行工作。

宣传通讯部　主负责院记者站工作，院对外宣传、新闻报道，以及院有关网站的建设和维护工作。　测绘成果质量检验部　负责院质量管理体系论证贯标，测绘成果质量检验，专利申请、保护和情报服务等工作。

GIS软件测评部　负责国产GIS软件测评的有关管理工作。

中国测绘学会信息网分会办公室　负责信息网分会的日常工作。