2016年7月22日，根据北京市委十一届十次全会相关部署，北京市人民政府决定：设立北京市规划和国土资源管理委员会，为市政府组成部门，挂首都规划建设委员会办公室牌子。不再保留北京市规划委员会、北京市国土资源局。

2018年11月8日，北京市规划和自然资源委员会揭牌，将原市规划和国土资源管理委员会、市勘察设计和测绘地理信息管理办公室的职责，以及市发展和改革委员会的组织编制主体功能区规划职责，市水务局、市园林绿化局的资源调查和确权登记管理职责等整合，组建北京市规划和自然资源委员会，作为市政府组成部门，加挂首都规划建设委员会办公室牌子。

市规划和自然资源委员会主要负责同志介绍，组建北京市规划和自然资源委员会是贯彻落实党中央、国务院深化机构改革要求的重大行动，也是北京市建设国际一流和谐宜居之都的重要决策，更是推进北京城市总体规划实施的重要举措。新机构的组建标志着改革的全面深化，体现着职能的优化加强，意味着使命的艰巨光荣。

市规划和自然资源委员会要切实增强深化机构改革的责任感、使命感、紧迫感，增强“四个意识”，坚定“四个自信”，做好“四个服务”。要充分发挥整合优势，实干担当，主动作为，切实履行好城市规划和自然资源管理职责，为建设国际一流的和谐宜居之都做出积极的贡献，不负市委市政府的期望和重托。