佛山市住房公积金管理中心内设三个科室：
（一）综合科
负责中心的日常行政事务；负责全市住房公积金管理网络的日常维护、升级和电子政务的开展管理工作，与全国住房公积金监督管理网络的协调工作等，保证整个住房公积金管理的电子化、网络化工作的正常运行。
（二）业务科
负责办理各单位、职工的住房公积金开户、缴存和变更、转移、封存、贷款，以及其他相关的业务等。负责政策解释和业务咨询；受理群众的来访、投诉等。指导各管理部开展各项业务。
（三）会计科
负责住房公积金的财务工作。建立市住房公积金专户帐和职工个人明细账，并依时记账、造册；负责与受委托承办住房公积金业务的银行对帐，对个人贷款进行核算、催收等；对各管理部的二级分帐进行指导和监督、检查等。
