国家重点实验室暂设6个分部，未来根据需要可拓展分部和分中心。分部下设若干研究项目组，实行责任专家负责制。根据理事会确定的任务目标，由责任专家负责联合优势单位进行单项技术细分，将研发任务分解为单独的模块，选择独立对象承担，通过资源的有效整合和互补完成重大技术突破。

1、基础材料技术研究部

侧重于200 lm/W中长期技术基础理论研究与新型白光技术路线探索，主要研究内容包括GaN同质衬底外延技术，深紫外LED制备技术，无荧光粉LED外延技术等。

2、核心关键器件研究部

侧重于核心关键器件共性技术集成创新研究，主要研究内容包括大尺寸150 lm/W大功率高亮度LED外延、芯片制备技术、大尺寸衬底制备，功率型封装及模组技术。

3、共性应用技术及系统研究部

侧重于解决产业急需的光、电、热、机械、软件、智能化控制系统等共性关键技术，开发低成本、高可靠系统集成技术及标准化、规格化应用产品，开发智能化照明控制系统。

4、创新照明应用技术研究部

侧重于解决半导体照明在农业、疾病治疗、光互联网络、航空、航天等跨学科、跨领域的创新应用技术研究，开展新的照明基础理论研究及建立标准体系。

5、知识产权运用及战略研究部

侧重于半导体照明知识产权运用及战略研究工作，主要研究内容包括产业发展动态监测、政策法规研究，持续的专利战略研究及建立专利预警机制，建立专利池和加强专利的成果转化。

6、综合与运行管理部

负责实验室相关项目管理、财务、人事、行政等公共事务管理与服务，包括实验室财务独立核算管理，编制年度财务预算，实验室组织机构、岗位的设置和调整，人事制度的建立、完善，人才的招聘、选拔及引进工作，人员聘用的相关管理工作，行政及公共事务的管理和服务工作。建立实验室内部质量管理体系及相关质量管理制度；负责对部门体系运行的有效性实时进行监控；全面负责质量管理体系的制定和管理,组织实施质量管理体系的审核和认证工作。