(一)办公室。负责局机关日常政务、事务工作，承办文秘、政务公开信息、年鉴、机要、保密、档案、目标管理、办公自动化工作;负责机关后勤服务工作;督办局党组决议、决定的执行情况和督办行政决定、工作布置的执行情况;负责系统内的干部管理和人事管理工作;负责系统内教育、培训工作。

(二)政策法规股(行政审批服务股)。组织贯彻执行交通法律法规规章;承担规范性文件的合法性审核工作;负责交通运输综合行政执法的指导、检查和执法监督工作。负责交通行政复议、行政诉讼、政策调研、执法队伍建设和法律法规业务培训工作;负责交通行业信访、建议提案办理工作;承办综治工作;指导交通行业体制改革工作;按规定受理、审查本部门行政许可项目;办理需要外业查证的行政许可项目。

(三)财务统计股。负责提出全县交通固定资产投资规模和方向。在县财政资金安排意见下，负责统筹全县交通收支预算的编制、使用、管理;负责审核编制全县交通基础设施项目建设资金预算;服务、协调交通建设资金的筹集工作;负责公路建设、养护等项目资金的拨付和局机关财务核算工作;负责系统内各种统计、调查、预测工作。

(四)交通综合业务股(物流办)。组织编制全县交通行业中长期发展规划、交通基础设施建设规划，组织编制、审核、上报、下达交通基础设施建设年度投资计划;负责全县农村公路建设项目的审查、审批工作;指导、服务、监督农村公路设计、招投标、工程造价等工作;指导全县农村公路建设、养护管理;负责全县公路、水路交通基础设施建设程序的审查、审批、工程招投标、工程进度、工程设计、造价控制、施工组织协调等工作;管理交通基础设施建设市场和交通工程技术标准、技术规范工作。负责监督检查农村公路建设质量，组织竣工验收工作。负责组织、协调全县交通战备工作，编制及实施全县交通战时保障方案。负责全县道路运输、水路运输、企业生产、交通基础设施建设的安全监督管理工作，协调交通重大事故的调查和伤亡事故的统计分析;负责本部门应急管理工作。负责指导、监督渔船检验和监督管理工作。负责全县物流发展规划、政策措施、主要节点的编制工作;组织全县重点物流载体建设和全县物流公共信息平台建设;负责整合社会物流资源，培育第三方物流企业，推动全县物流产业发展;负责全县物流技术和物流标准应用和管理;负责全县物流行业统计、调查和经济分析;开展区域物流交流合作;负责全县物流服务体系建设工作。指导、服务全县道路运输、水路运输、城区客运行业管理;协调道路、水路、铁路等运输方式的衔接;负责重点物资、紧急客货运输调控和春运工作的组织协调;指导、服务运输行业技术标准管理。

党总支。负责机关和所属单位党群工作。