来料加工贸易和进料加工的这两种加工贸易的共同之处在于原材料和元器件来自国外，加工后成品也销往国外市场。但两者有本质上的区别：
进料加工贸易中，进口料件和出口成品是两笔独立的交易，进料加工的企业需自筹资金从国外购入料件，然后自行向国外市场销售，而装配加工贸易则进、出为一笔交易的两个方面料件和成品的所有权均同委托方所有，承接方无需支付进口费用也不承担销售风险。
进料加工贸易中，企业所获得的是出口成品的利润，利润的大小取决于出口成品的市场行情、而加工装配贸易，承接方收取的是工缴费，工缴费的大小以劳动力的费用，即工资水平作为核算基础。两者相比，进料加工贸易的收益大于加工装配贸易，但风险也较大。
进料加工贸易，企业有自主权，根据自身的技术、设备和生产能力，选择市场上所适销商品进料加工。而加工装配贸易，则由委托方控制生产的品种、数量和销售地区。
