(一)政办科
负责局机关日常运转工作;负责重要会议组织和决定事项的督办;负责重要文稿草拟审核、公文管理、政务公开、宣传、机要、保密、档案、信访、接待服务和各类大型活动的组织协调工作;负责局机关财务和固定资产管理等工作;负责人大代表建议和政协委员提案的办理;承担局机关和所属事业单位的干部人事、机构编制、劳动工资工作;承办局党组管理的领导班子和领导干部的培养、选拔、交流、任免等管理工作;指导水利行业人才队伍建设;组织实施局机关目标责任考核和奖惩工作;承担部门党建、党风廉政建设、精神文明建设、综治维稳和群众团体工作;负责局机关离退休人员的服务管理工作。
(二)规划计划科
组织编制重大水利综合规划、专业规划和专项规划,负责全市重点水利工程前期工作;指导江河干堤、重要病险水库、重要水闸的除险加固;负责全市水利工程建设项目招投标活动、可行性研究、初步设计审查工作;指导水工程建设项目合规性审查工作;提出中、省、市水利固定资产投资计划并组织实施;协调开展项目实施后评价和绩效评价;负责全市水利资金内部审计工作;组织实施水利水电工程移民安置前期工作、移民安置验收和监督评估等制度,负责移民安置资金监督管理;指导监督水库移民后期扶持政策的实施;承担全市水利统计、综合业务文件起草、信息报送等工作;指导水利工程造价管理工作;负责重点水利工作任务分解及督促落实;指导全市水利产业园区、水利风景区建设管理工作;提出有关水利价格、收费等建议。
(三)农村水利水电科
编制全市城乡供水规划、计划;指导全市县城供水的建设管理、水价调整、运行管理等工作;指导全市农村饮水安全工程和农村饮水水质检测的组织实施、运行管理等工作;组织开展灌排工程建设与改造,指导节水灌溉有关工作;承担农村水电行业安全生产管理和国家补助项目的实施;指导全市农村水能资源开发工作,负责全市农村水电行业行政管理工作;指导农村水利社会化服务体系建设;指导农村水利管理体制改革、农业水价综合改革等工作;组织、指导和协调实施全市水利扶贫脱贫工作。
(四)水资源水保科(全市节约用水办公室)
承担实施最严格水资源管理制度相关工作,组织实施水资源取水许可、水资源论证、用水总量控制等制度,指导开展水资源有偿使用工作;指导水量分配、水资源调度工作,指导河湖生态流量水量管理工作;组织编制水资源保护规划,指导饮用水水源保护相关工作;指导全市地下水工作;发布全市水资源公报;组织编制并协调实施节约用水规划;指导和推进节水型社会建设工作;组织编制全市水土保持规划并监督实施,负责水土流失综合防治、监测预报并定期公告;负责建设项目水土保持监督管理工作,指导重点水土保持建设项目的实施;指导水利普法工作;承办行政应诉、行政复议、行政赔偿等工作;组织指导水政监察和水行政执法工作。
(五)建设监督管理科
负责全市水利工程建设的行业管理;负责组织全市重点水利项目的技术审核审查,参与技术指导及项目验收;指导水利工程蓄水安全鉴定和验收;负责水利行业技术标准、规程规范的宣传贯彻和监督实施;负责水利项目稽查工作;指导水利建设市场的监督管理和信用体系建设;指导实施水利工程质量和安全监督;指导水利行业安全生产工作,负责水利工程质量、安全事故的调查处理;负责水利科技工作;组织重大水利科学研究、技术引进和科技推广;负责全市水利干部职工业务培训工作;负责水利行业对外协作工作。
(六)河湖长制工作科
指导全市水域及其岸线的管理和保护,指导重要江河、湖泊、水库、滩涂、河口的开发、治理和保护;指导河湖水生态保护与修复及河湖水系连通工作;监督管理河道采砂工作,指导河道采砂规划编制,组织实施河道管理范围内工程建设方案审查制度;承担防洪保护区的洪水影响评价工作;组织编制洪水干旱灾害防治规划和防护标准、重要江河湖泊和重要水工程的防御洪水抗御旱灾调度以及应急水量调度方案并组织实施;负责水情旱情监测预警工作;指导水利工程水毁修复、山洪灾害防御相关工作。