（一）办公室。负责局机关日常运转工作。负责重要会议协调和决策事项的督办，重要文稿草拟审核、公文管理、政务公开、应急值守、网络信息、新闻宣传、机要、保密、档案、信访、安全保卫和局机关固定资产管理等工作。承担管理局系统预、决算，局机关财务核算管理工作；指导局属单位财务管理工作；负责局属系统政府采购和国有资产的监督管理工作；承担局属单位内部审计工作；负责精神文明建设工作。

（二）人事教育科。承担局机关和局属单位的机构编制、干部人事、劳动工资、培训、专业技术职务评聘等工作；负责离退休人员的服务和管理工作；负责党的建设、党风廉政建设和水利行业人才队伍建设；组织实施目标责任考核工作；承担干部人事体制改革有关工作。负责工会、共青团、妇儿等群团组织工作。

（三）规划计划科。组织编制重大水利综合规划、专业规划和专项规划；组织编制、审核中小型水利建设项目建议书、可行性研究报告和初步设计；指导水利工程建设项目合规性审查工作；组织实施中央和省市级水利固定资产投资计划；协调开展项目实施后评价和绩效评价；承担局属单位的中央和省市级水利资金监督管理工作；承担全市水利统计工作；指导水利工程造价管理工作。负责全市水利工程建设的行业管理；指导水利工程蓄水安全鉴定和验收；指导水利建设市场的监督管理和水利建设市场信用体系建设；指导实施水利工程质量和安全监督；指导水利行业安全生产和水利反恐工作；指导市内水利工程建设项目招标投标活动。承担大中型水利水电工程相关前期工作。负责全市水利水电工程移民安置和后期扶持的指导和监督管理工作；负责大中型水利水电工程建设征地移民安置前期工作的审查审核工作；负责大中型水利水电工程移民安置的验收工作；负责大中型水利水电工程移民后期扶持政策的实施和管理工作；负责小型水库移民后期扶持有关工作；负责新建大中型水库移民后期扶持人口的核定工作；负责治污降霾工作。

（四）水利水保科。指导城乡饮水安全工程建设和管理工作；负责全市水土流失综合防治、监督管理和监测评价；组织编制全市水土保持规划并监督实施，组织开展水土保持规划实施考核评估工作，组织全市水土流失调查、动态监测、预防并公告；指导水土保持重点工程实施；承担全市能源资源开采水保补偿费征稽管理及恢复治理项目的监管。指导节水灌溉有关工作；组织开展大中型灌排工程建设与改造；指导全市农村水能资源开发工作，负责全市农村水电行业行政管理工作；承担全市农村水电行业安全生产管理和国家补助项目的实施；指导农村水利社会化服务体系建设；组织、指导和协调实施全市水利脱贫攻坚工作。

（五）水政水资源科。起草水利方面的地方性法规和政策规章草案；研究拟订水利工作政策措施并监督实施；指导水利行政许可工作并监督检查；指导水利普法工作；承办局行政应诉、行政复议和行政赔偿等工作；组织指导水政监察和水行政执法、协调跨流域、跨县区的水事纠纷，组织查处重大涉水违法事件；负责行政审批事项监管和协调，承担水利改革方面工作。承担实施最严格水资源管理制度相关工作，组织实施水资源取水许可、水资源论证等制度，指导开展水资源有偿使用工作；指导水量分配、水资源调度工作，指导河湖生态流量水量管理工作；组织编制水资源保护规划，指导饮用水水源保护相关工作；组织开展水资源调查、评价有关工作；指导全市水文、地下水工作；发布全市水资源公报、水文水资源信息情报预报；参与编制水功能区划；参与指导入河排污口设置管理工作。拟订节约用水政策，组织编制并协调实施节约用水规划，指导计划用水、节约用水；组织实施用水总量控制、用水效率控制、计划用水和定额管理制度；指导和推动节水型社会建设工作；执行规程规范并监督实施；负责水利科技和对外协调工作。组织制订水生态建设规划并组织实施；组织实施水生态水环境建设工作；监督和指导水生态建设项目、资金使用工作。负责落实综合防灾减灾规划相关工作，组织编制洪水干旱灾害防治规划和防护标准并组织实施；承担水情旱情监测预警工作；组织编制重要江河湖泊和重要水工程的防御洪水抗御旱灾调度及应急水量调度方案，按程序报批并组织实施。承担防御洪水应急的技术支撑。负责水文监测工作。负责水文水资源、江河湖库和地下水监测，发布水文水资源信息、情报预报和全市水资源公报。按规定组织开展水资源、水能资源调查评价和水资源承载能力监测预警工作。负责扫黑除恶专项斗争工作。

（六）河湖管理科。指导水域及其岸线的管理和保护，指导全市重要江河、湖泊、水库、滩涂、河口的开发、治理、修复和保护；负责江河堤防、病险水库、水闸的除险加固，指导河湖水生态保护与修复及河湖水系连通工作；监督管理河道采砂工作，指导河道采砂规划编制，负责权限内采砂规划审批。指导水利设施的管理、维修养护和综合利用。负责河道管理范围内水利工程运行管理、工程建设方案审查。负责违建别墅清查整治、秦岭保护、生态环保等专项工作。

（七）总工办。负责专家库和项目库建设，负责水利项目前期谋划、技术审查、稽查管理。协助县区及有关单位做好省审项目的协调工作，完善各类技术成果报告，为领导决策做好技术咨询。指导并推进县区项目申报上报工作。负责拟定相关技术标准、规程规范并监督实施。