根据上述职责，巴中市住房和城乡建设局设7个内设机构：
（一）办公室（信访和群众工作科）
负责局机关政务协调、文电处理和外事工作；负责重要文件、文稿的起草、审查和报批；负责政务信息、政务公开、对外宣传、目标管理、文书档案工作；负责局综合性会议的组织协调和会议决定事项的督办工作；组织办理人大代表建议、政协委员提案工作；负责指导住房和城乡建设系统法制建设；负责维稳和社会治安综合治理、计划生育、机要和保密工作；负责机关后勤保障、设备以及固定资产管理工作；负责接待、转办或承办群众来信来访工作和督查督办重大信访案件。
（二）住房改革与保障科
拟订全市住房政策、规章制度并组织实施；指导全市住房建设和住房制度改革；组织编制全市保障性住房建设规划、住房保障发展规划和年度计划并监督实施；会同有关部门做好市级保障性住房资金安排并监督实施；会同市规划管理局负责保障性住房建设项目方案的审查；会同有关部门拟订全市住房公积金管理相关配套政策并组织实施；承担市住房制度改革领导小组办公室、市住房公积金管理委员会办公室日常工作。
（三）房产市场监管科（市房地产管理局）
拟订全市房地产业发展规划、产业政策和规章制度；拟订房产市场监管和稳定住房价格的政策、措施并监督执行；拟订商品住宅发展规划；负责城镇住宅建设、房产开发、房屋征收补偿、房产交易、房屋权属登记、产权产籍管理、物业管理、房屋安全鉴定、白蚁防治和房产中介服务的监督管理工作；负责房地产开发企业、物业服务企业、房产中介等行业机构资质及其人员执业资格的监督管理工作；指导农房产权产籍管理工作；会同市规划管理局负责旧城改造涉及征收与补偿方案的审查；会同市城市管理行政执法局负责房地产市场违法违规行为的处理；负责商品房预售许可、房屋权属登记、物业管理企业三级资质审查、廉租住房申请核准等行政许可、审批事项办理。
（四）城乡建设科
拟订全市城市建设、村镇建设、市政公用事业的发展规划、产业政策并监督实施；负责城市燃气、热力、市政设施（城市道路、桥梁、广场、雕塑、路灯等）、园林绿化的监督管理工作；负责编制城市重大建设项目、重点工程的年度计划并监督实施；会同市规划管理局负责城市总体规划和城镇体系规划的审核、市政设施建设和重大工程项目的规划选址及方案评审；负责市政公用事业单位（企业）资质及其人员执业资格的监督管理工作；负责指导农村住房建设、建设质量管理、危房改造工作；指导全市重点镇建设、村镇建设试点工作；负责办理占用挖掘拆改市政基础设施及附件管道杆线等设施、改动燃气设施、城市新建燃气企业、占用城市绿地和移植砍伐城市树木等行政许可、审批事项；会同市规划管理局负责历史文化名城及历史文化街区保护的监督管理和相关审查报批工作；会同市城市管理行政执法局负责城乡建设中重大违法违规行为的处理；指导城乡环境综合治理工作；承担市小城镇建设领导小组办公室日常工作。
（五）建筑管理科（科技与勘察设计科）
拟订全市建筑业、勘察设计咨询业发展规划和行业政策；拟订招标代理、建筑施工、工程监理、工程检测、工程担保等市场准入与清出管理的规章制度并监督实施；负责建设工程质量和施工安全的监督检查，参与工程重大质量、安全事故的调查处理；负责市外入巴建设类企业及个人执业行为的监督管理；负责各类房屋建筑工程和市政基础设施工程招标投标活动的监督执法；负责工程竣工验收备案和指导建筑行业诚信体系建设；牵头组织建筑业企业参与国内国际工程承包、建筑劳务合作以及建筑技术工人的培训、输送工作；负责建筑工程企业、勘察设计咨询企业（单位）资质及其人员执业资格的监督管理工作；负责建筑工程施工许可、建设工程质量监督手续审批、建筑业企业三级资质审查等行政许可、审批事项的办理；拟订住房和城乡建设行业科技、建筑节能、墙体材料革新、散装水泥推广的发展规划和地方性政策；组织工程建设设计标准的推广应用；负责组织重大公共建设项目的初步设计技术审查工作；负责监督管理施工图设计审查、工程勘察、设计合同；指导建设工程抗震设防工作，组织开展城市建筑物抗震性能普查、鉴定加固和改造；会同市规划管理局负责城市规划区内建设项目定点选址、规划设计条件出具、规划设计方案审查、用地规划许可、工程规划许可、规划专项验收等工作；会同市城市管理行政执法局处理建筑市场和勘察设计市场违法违规行为。
（六）人事教育科
负责局机关和直属单位的机构编制、人力资源、工资福利、社会保障及离退休管理工作；负责干部职工的培训、考核、奖惩工作；拟订全市建设行业人才发展规划，指导建设职业技能培训、岗位培训、职业技能鉴定、专业技术人员继续教育等工作；负责全市建筑专业技术职务任职资格评审、聘任及申报工作；指导行业从业人员执业资格培训、考试及审查工作；负责党风廉政建设有关工作；指导住房和城乡建设系统各类社团工作。
（七）计划财务科
负责编制市本级住房和城乡建设的投资计划、利用外资计划；综合管理市本级住房和城乡建设各项专项资金；负责城市建设配套费的核算、收取、监管工作，会同财政部门编制使用计划；负责行政审批（许可）事项中涉及建设规费的核定与征收工作；负责局机关财务管理工作；负责直属事业单位的财务监督审计、固定资产清产核资工作；指导和协调本系统行政事业性收费和政府基金项目管理工作；负责住房和城乡建设行业统计工作。
