办公室

处理局机关日常政务，负责有关会议材料和有关报告、文件及机关管理制度的起草；负责审计宣传、信息调研和机关文电处理、保密、档案管理等工作；负责局机关财务会计及机关后勤管理工作；负责办理局机关的机构编制、干部任免、人员调配、工资福利、考核奖惩、专业技术职称考评和人事档案管理等工作。负责局机关和直属单位的党群和退休人员的管理服务工作。

综合计划科

编制并实施年度审计业务工作计划，负责审计业务统计工作，负责组织审计业务培训和计算机辅助审计技术的实施，指导和监督内部审计工作。

法制科

负责规范性文件的起草、修改和报批工作，办理市人民政府和省审计厅有关规范性文件制定或修订中征求意见的收集和汇总工作；受理审计行政复议和应诉，组织实施审计普法教育；负责审计项目的审计复核和审理工作；参与审计业务科室重要审计项目征求被审计单位意见的有关会议；负责重要审计业务会议的组织工作。

财政审计科

负责对市本级财政一般预算收支执行情况、基金预算收支执行情况及具体组织收入征收部门收入征收情况的审计；负责对区县政府的财政决算情况进行审计；负责审计由市政府有关部门管理的社会保障资金、住房公积金、残疾人保障金、社会福利资金、救灾救济资金、优扶安置资金和社会捐赠资金的筹集、使用、管理情况；组织相关专项审计和审计调查。

行政事业审计科

负责审计与市级财政有拨、缴款关系的市直行政单位（含市委机关及市委所属各部、委、办、市人大机关、市政府机关、市政协机关、市法院机关、市检察院机关）及其下属非独立审计对象单位的财政财务收支情况；负责审计归口各行政单位管理的各项专项资金的筹集、使用和管理情况；组织相关专项审计或审计调查。

农业与资源环保审计科

负责审计监督由市政府部门及其委托管理的资源环保、农林水利、扶贫开发资金；负责审计监督国土资源、环境保护、安全监督、农业、林业、水利等部门及其所属单位的财务收支；组织相关专项审计或审计调查，指导全市农业与资源环保审计业务

企业外资审计科

负责对市属国有企业或国有资产占控股地位或主导地位的企业及其所属单位的资产、负债、损益及财务收支的审计监督；负责对国际组织和外国政府援助、贷款和赠款项目的财务收支审计；组织相关专项审计或审计调查。

建设资金审计科

对使用市本级政府投资、融资为主及市本级政府实际投资、融资占项目总投资的比例在50%以下但拥有项目建设、运营实际控制权的建设项目的概预算执行情况、决算进行审计监督；对有与国家建设项目有关的设计、施工、供货等单位取得建设项目资金的真实性、合法性进行审计调查；核查市本级财政投资评审中心对国家建设项目概预算执行、决算评审后所作出的评审结论以及有关社会中介机构出具的国家建设项目工程造价咨询报告；组织相关专项审计或审计调查。

经济责任审计处

负责市领导干部经济责任审计领导小组办公室日常工作，协调各成员单位运用经济责任审计成果；受市委组织部委托，对市管干部的任期经济责任进行审计监督。

审计技术科

负责全市审计系统的计算机审计技术工作；配合局机关审计业务科室开展计算机审计技术服务；承担重大审计项目的计算机审计技术工作；指导和推广信息技术在全市审计系统的应用，承担全市审计机关实施管理系统和现场审计系统建设的有关工作，组织开展信息系统审计和联网审计；组织、协调、指导全市审计系统“金审工程”项目实施工作。

市建设项目审计中心

根据授权，对财政性资金、企事业组织管理和使用的国有资产、国有企业和事业组织自筹资金或银行贷款、国际组织和外国政府援助资金或贷款、社会公益性资金投资或者融资为主的基本建设项目、技术改造项目的招投标、预决算和资金使用情况进行审计。