（一）办公室（信访科）。综合协调局机关和直属单位行政事务，制定局机关内部管理制度；负责文电、会务、机要、档案等机关日常工作；负责重要文件和报告的起草工作；承担宣传、保密、接待、督办、建议提案办理、政务公开、诚信体系建设等工作；承担受理、交办、转办、督促信访事项；归口管理交通血防工作。
（二）规划统计科（交通战备办公室）。负责组织拟订全市综合交通运输发展战略、政策和中长期发展规划，协调和组织编制全市综合交通运输体系规划并监督实施；参与拟订全市公共交通、物流业发展、轨道交通、智能交通、地方铁路专用线、民航等交通专项规划并监督实施；负责拟订全市普通公路建设、养护计划并监督实施；负责全市交通建设项目前期工作; 负责交通科技、引资项目管理工作；负责全市交通战备办公室日常工作；承担综合交通运输统计工作，发布有关信息。
（三）基本建设科。负责组织拟订全市普通公路、地方铁路、民航建设项目的行业政策、规章和技术标准；负责全市普通公路、地方铁路、民航建设市场的培育、管理和监督，维护平等竞争秩序；负责全市普通公路、地方铁路、民航建设行业监督管理工作；负责对普通公路建设、养护工程项目的招投标、施工许可、工程变更、工程造价、工程质量、项目竣（交）工验收实施管理和监督；负责市级交通运输重点基本建设项目的绩效监督和管理；负责在建工程项目环境保护工作。
（四）运输管理科。负责全市道路、地方铁路、民航、管道运输的行业管理和城乡客运一体化；承担道路运输、地方铁路、民航市场监管和运输线路、营运车辆、站场枢纽、客运站点等管理工作；负责城区从事汽车租赁、机动车维修经营、机动车驾驶员培训备案，指导全市汽车租赁、机动车维修管理、机动车驾驶员培训；负责道路运输行业节能减排等环境治理；负责重点物资运输、运力保障等工作；协调交通运输行业的价格和收费标准的制定。
（五）公交管理科。贯彻执行国家和省市关于城市公交、出租车等相关政策法规；组织拟定辖区内城市公交、出租车发展规划和管理政策、制度及相关标准并监督实施；负责辖区内城市公交、出租车监督管理；负责城市公交、出租车行业节能减排工作。
（六）物流管理科。参与拟订全市物流业战略、规划，拟定物流业发展政策、措施，并组织实施；指导、服务和监督全市物流园区的建设和发展；负责推进物流企业提质升级和物流信息化建设；协调物流行业多种运输方式的融合发展。
（七）安全监督科。负责权限内全市交通运输行业安全生产监督管理和综合协调；拟订全市交通运输行业安全生产规章制度；按规定组织协调或参与有关事故调查处理；负责安全应急管理；编制交通运输行业安全管理经费使用计划。
（八）法制科。负责全市交通运输行业法制建设；组织起草地方交通运输规范性文件，对局机关重大行政决策进行合法性审查；组织全市交通运输行业法律法规的宣传和普法工作；承担全市交通运输行政执法监督检查和执法人员培训工作，指导全市交通运输行业执法队伍建设；负责市直交通运输系统社会治安综合治理工作；拟订全市路政管理相关政策和技术标准并监督实施；负责全市国省干线公路路政管理及超限超载治理，指导高速公路、农村公路路政管理；负责全市公路“三乱”治理工作；承办局机关行政复议、行政诉讼等工作。
（九）行政审批科。依法负责公路建设项目施工批准、公路（桥梁）范围内涉路施工审批、超限运输车辆行驶公路审批、道路危险货物运输企业的从业人员资格认定、营业性道路运输从业人员资格认定、巡游出租汽车经营权审批及相关资格证件核发、网络预约出租汽车经营权审批及相关资格证件核发、省（市、县）际道路旅客运输经营许可、机动车驾驶员培训经营许可、道路运输客运站（场）（三级）经营许可、道路货物运输（含危险货物运输）及相关服务业经营许可等11大项行政审批事项；负责协调相关职能部门、各业务科室对行政审批事项的后台支持工作；负责进驻市政务服务中心的行政审批服务事项工作及窗口人员的管理。
（十）公路管理科。宣传贯彻农村公路管理相关法律、法规；组织拟订全市农村公路发展规划、农村公路建设、养护年度计划并监督实施；负责全市农村公路建设监督管理工作；承担全市农村公路调查、统计和路况技术标准评定工作；负责农村公路建设、养护和管理的绩效考核，指导全市农村公路建设。
（十一）审计科。负责贯彻落实国家有关行政审计政策法规；负责拟订全市交通行业审计工作规章制度，指导局属单位内部审计管理工作；组织开展对局直属单位财务收支、预算执行和局属单位主要领导干部任期经济责任等审计工作；组织开展市本级交通基础设施和交通维护项目预决算审计；负责局专项资金使用情况及负有监督责任的其他相关项目的专项审计或审计调查工作。
（十二）人事科。负责局机关和直属单位的干部人事、劳动工资、机构编制和教育培训等管理工作；按照干部管理权限, 承办局机关和直属单位干部选拔、考核、培训、任免、奖惩、调配及因私出国（境）等事项；负责交通运输行业精神文明建设和职工队伍建设的日常工作；负责专业技术人员管理、职称评定、技工职业技能鉴定和等级考核、人才交流、智力引进工作。
（十三）财务科。指导、监督全市交通运输行业的财务工作，组织制定相关规章制度并监督执行；负责全市交通运输各项资金的管理、拨付和监督；负责交通国有资产管理和交通投、融资管理；负责交通基础设施产权转让的审查报批；负责局机关财务管理和直属事业单位财政预算、决算的审查、报批和公开。
机关党委（纪委）。负责局机关和直属单位的党群、纪检工作。
离退休人员管理服务科。负责本单位离退休人员管理服务工作。
