直属站15个:沈阳站、大连站、锦州站、山海关站、丹东站、通辽站、长春站、长春北站、四平站、金州站、裕国站、苏家屯站、沈阳北站、沈阳南站、大连北站。
国境站3个:丹东站、图们站、集安站。
车务段15个:霍林郭勒运营维修段、阜新车务段、长春车务段、通化车务段、梅河口车务段、延吉车务段、吉林车务段、赤峰车务段、通辽车务段、锦州车务段、大连车务段、本溪车务段、鞍山车务段、沈阳车务段、白城车务段。
客运段5个:沈阳客运段、大连客运段、长春客运段、吉林客运段、锦州客运段。
机务段8个:沈阳机务段、大连机务段、吉林机务段、通辽机务段、锦州机务段、苏家屯机务段、梅河口机务段、白城机务段。
供电段8个:沈阳供电段、大连供电段、长春供电段、吉林供电段、通辽供电段、锦州供电段、白城供电段、阜新供电段。
工务段17个:长春高铁基础设施段、沈阳高铁维修段、阜新工务段、四平工务段、长春工务段、延吉工务段、通化工务段、沈阳工务机械段、山海关工务段、鞍山工务段、吉林工务段、丹东工务段、大连工务段、白城工务段、锦州工务段、通辽工务段、沈阳工务段。
车辆段7个:沈阳客车厂、长春车辆段、沈阳车辆段、苏家屯车辆段、锦州车辆段、吉林车辆段、通辽车辆段。
电务段6个:沈阳电务段、大连电务段、长春电务段、吉林电务段、通辽电务段、锦州电务段。
动车段1个:沈阳动车段。
运输辅助单位5个:长春房产段、通辽房产段、沈阳房产段、吉林房产段、锦州房产段,
非运输企业:北京奉发商贸有限公司、辽宁铁信实业集团有限责任公司、通辽铁盛商贸(集团)有限公司、沈阳铁道丹东铁成集团有限责任公司、沈阳铁道国际旅行社(集团)有限公司、沈阳铁道双瑞站车商业服务有限公司、辽宁港铁国际物流实业有限公司、沈阳铁路建设监理有限公司、沈阳铁道物流集团有限公司、东北大厦酒店集团有限责任公司、沈阳铁道工业集团有限公司、沈阳铁道石油化工集团有限公司、沈阳铁道文化传媒集团有限公司、沈阳铁道工程建设集团有限公司、沈阳铁道长春春铁集团有限公司、沈铁松原三江港实业集团有限公司、沈阳铁道长春春铁集团公司。