一、指导水利设施、河道、湖泊、水域及其岸线的管理和保护，指导江河、湖泊的治理和开发。
二、
三、组织编制水库运行调度规程，指导水库、水电站大坝、堤防、水闸等水利工程的运行管理与确权划界。
四、组织实施具有控制性的或跨省（自治区、直辖市）及跨流域的重要水利工程建设与运行管理。
五、指导大江大河干堤、重要病险水库、重要水闸的除险加固，组织实施中央投资的病险水库、水闸除险加固工程的建设管理。
六、指导水利建设市场的监督管理，负责水利建设市场准入、项目法人组建、工程招标投标、建设监理、工程造价和工程质量检测的监督管理，组织指导水利建设市场信用体系建设。
七、组织指导河道采砂管理，指导河道管理范围内建设项目管理有关工作，组织实施河道管理范围内工程建设方案审查制度。
八、承担水利部援藏工作领导小组办公室的日常工作。
九、承办部领导交办的其他事项。
