莆田市秀屿区交通局机关行政编制6名。其中局长1名，副局长3名。

莆田市秀屿区交通局内设办公室。

莆田市秀屿区交通局主要职责：

（一）贯彻国家和省有关公路，水路交通和业的发展战略、方针、政策和法规，并监督监督执行。

（二）根据我区国民经济和社会发展的需要，拟订全区公路和水路近期与远期相结合的交通行业发展战略及规章制度，经批准后，负责实施，协调和监督工作。

（三）根据全区的总体布局，组织编制全区公路和水路交通行业发展规划、中长期和年度计划，并组织实施。组织开展区重点和大中型交通基础设施建设项目及中央投资、省投资、省市区合资、利用外资建设项目的前期工作和后期评价工作，并对项目报批提出行业意见。负责全区交通行业统计管理和信息引导。

（四）管理全区公路、水路交通基础设施建设市场。负责全区公路、水路交通建设工程招标管理和工程质量管理。负责公路、水路交通战备工程的组织实施，组织重点交通工程建设的实施，负责辖区高速公路支线的建设和管理。负责或协助省交通厅，市交通局组织公路、水路建设工程设计审查、竣工验收。行使全区公路、运输场站、港口、内河航道及其设施的建设、养护、管理等行业管理职能。

（五）管理全区公路、水路交通运输市场。行使全区公路、水路客货运输（含城市出租汽车客运管理）、搬运装卸、汽车船舶维修（含汽车综合性能检测）、运输服务业（含公路营运车辆停发车场）的行业管理职能，维护公路、水路交通行业的平等竞争秩序。负责公路、水路交通运输组织管理，对重点物资运输、紧急客货运输进行调控。引导交通运输行业优化结构、协调发展。负责对外对台有关交通具体工作。

（六）行使汽车驾驶学校和驾驶员培训工作的特业管理职能，贯彻国家有关技术标准、教学大纲，负责制定管理规章和总体布局规划并实施监督检查。

（七）受区财政部门委托，负责交通直属单位国有资产的管理和保值增值的监督。组织各项交通规费（含省政府批准的还贷公路通行费）的征收、管理、使用和监督。

（八）负责全区公路路政管理工作，行使公路路政的行政管理职能。检查、指导、协助全区公路两则建设控制区、超过公路或省公路桥梁限载标准的车辆行驶公路和公路路产的管理工作。

（九）负责交通行业安全生产监督管理。负责内河水上安全监督，内河船舶（不含渔业捕捞船舶）及水上设施检验、航行保障、救助打捞。组织指导行业环境保护工作。行使交通通信行业管理职能。

（十）负责局机关、局属单位的人事、工资、机构编制办理；指导交通行业劳动工资、劳动保护工作；组织指导交通行业人才预测，指导交通行业各工种和工人职业技术培训、鉴定工作；指导交通行业体制改革、企业改革及其管理工作。

（十一）贯彻交通行业科技政策，制定科技发展项目中长期规划和年度计划；负责组织交通行业重大科技开发和科技成果推广，指导交通企业的技术改造和车船更新，推动行业技术进步，负责交通行业的技术和质量监督。

（十二）指导全区交通行业法制工作。归口管理交通行政复议和应诉工作；归口管理和指导交通执法监督检查工作。负责组织和指导全区交通行业的“普法”工作。

（十三）负责规划全国国防交通网络布局，组织实施国防交通战略硬件建设；拟订国防交通战略保障计划；管理、训练国防交通战略保障队伍；负责国防运力动员和征用、国防交通物资的储备和调用。

（十四）指导交通行业的精神文明建设和职工队伍建设。

（十五）承办区政府和省交通厅、市交通局交办的其他事项。

1.莆田市秀屿区水土保持监督站

2.莆田市秀屿区水政监察大队

3.莆田市秀屿区三峡库区移民安置工作站

4.莆田市秀屿区洪水预警报

5.莆田市秀屿区水利工程质量监督站

6.莆田市秀屿区水利工程管理站

7.莆田市秀屿区水利工程管理所

8.莆田市秀屿区水政水资源管理站

根据《中共莆田市委、莆田市人民政府关于印发莆田市秀屿区机构设置方案的通知》（莆委[2002]74号），设置莆田市秀屿区水务局。莆田市秀屿区水务局是区政府的工作部门，机构规格为正科级。

莆田市秀屿区水务局内设办公室。