棉签可以用来清洁用传统的方法无法到达或清洁的区域、裂缝和缝隙。一旦棉签拾起了残留物，就不能让它再掉出去。棉签采样可能是应用最广泛的清洁确认采样技术。这是在清洁确认评估中最重要的环节。棉签和基片 表面的物理特征和物理擦拭移动在物理确认程序中都起到了一定的作用。化学程序包括用蘸湿的棉签从基片表面上获取要分析对象的样本，然后从棉签中提取分析物，最后再把棉签放到恢复溶液中。擦拭移动的步骤必须标准化，这样才能保证在分析研究过程中通过擦拭移动再现、进行恢复确认。这个程序应列入标准的操作程序中。

有一种特殊的办法可以蘸湿棉签头并且防止因棉签头上的液体过量而使残留物扩散出去、进入周围的表面。技术上的错误会导致相互矛盾的结果。棉签需要蘸湿而不是彻底浸透。经过预清洁处理的小瓶子和棉签，溶液的TOC本底不超过10ppb，棉签的TOC本底不超过50ppb。

使用棉签进行确认和清洁。技术人员用棉签擦拭只有一平方英寸的面积进行表面确认。人们经常把这些棉签的手柄折断，这样就可以把棉签放入盛有溶液的容器中，从棉签中提取微粒。

《WG-CC025:洁净室棉签的评价》是IEST出版的一个推荐做法，内容是供洁净室和污染控制环境使用的棉签的洁净程度和功能的测试办法。

棉签厂商可以按照用户的具体要求生产出各式各样的棉签,不同类型的棉签的主要区别在于手柄的长度和材 料，棉签头的尺寸、形状和材料，溶剂的存留性、吸收性和吸附能力。泡沫熟料、聚酯材料和棉花都是用来生产棉签头的原材料。棉签头可以用加热粘接、折叠或者融化焊接等方法加工。一些新的棉签头呈螺旋形，可以擦掉更多的碎屑。

用聚酯材料生产出来的棉签，非挥发残留性(NVR)低、微粒脱落少而且具有耐化学性。通过分析有机碳总量(TOC)发现，用净化的聚酯材料编织生产出来的棉签可释放的微粒数量少、复原性好而且总有机碳本底水平低。

用于手柄生产的材料包括聚丙烯、尼龙、玻璃尼龙、玻璃聚丙烯、木头或者苯乙烯。棉签的手柄长度(7-25cm)和棉签的形状和尺寸(从4mm到16mm以上)要根据具体的要求确定。还可以在手柄上开槽，方便折断。

棉签的吸收能力因产品而异，包装形式多种多样，例如抗静电放电包装和符合洁净室要求的包装。制药工厂和那些使用"现行"GMP管理的环境要求使用无菌棉签。一些棉签使用不含粘合剂材料生产。

无尘防静电Y系列棉签是专为高度洁净以及需要防静电产生的环境所设计。无尘防静电棉签头部采用聚氨酯海绵、连续长丝聚酯纤维和超细纤维做原料并在10级(ISO4级)净化室处理工艺保证擦拭棒的超低离子含量和非挥发性残留含量(不含硅, 氨和邻苯二甲酸二辛酯DOP),以及超低颗粒产生.无尘防静电棉签完美的封边收口技术使头部成功地固定在聚丙烯手柄上，避免了使用粘合剂所带来的污染。防静电技术的应用保证了您的产品不受静电的侵害。无尘防静电棉签良好的抗化学品性能(可以与异丙醇等溶剂一起使用，适用于油滑剂和其它液体)，用于清洁敏感材料(如各类液晶显示器、光学镜头)，电子器件(如硬碟、半导体、线路板、光碟、)，微型机械清洁、光学仪器，光纤，电子显微镜，光学感测器等。同时还适用于医学工业(细胞取样、DNA检测)，食品工业及化妆工业行业。