1)潜油电泵下入深度受电机额定功率的限制，套管尺寸和井底高温时潜油电泵的下入深度受到限制。大型高功率设备没有足够的环形突然空间冷却电机，会缩短电机的使用寿命。
2)由于多级大功率潜油功率比较昂贵，使得初期投资比较高，特别是电缆的费用较高。如果需要搞腐蚀或耐高温，则费用会更高。
3)由于整套装置都安装在井下，一旦出现故障，需要起出全部管柱进行修理，导致作业费用增加和停产时间过长。
4)井下高温容易使电缆出现故障，高温、腐蚀和磨损可能造成电机损害。高气油比会使升举故障降低，而且会因气锁使泵发生故障。
5)动力源仅适应采用电源。
