籽播：日本花柏籽播宜于春季进行，用种子繁殖，播前需在低温下层积处理。当年苗高 10~15cm。

扦插：软枝、硬枝扦插均可。

压条：有些品种可进行压条繁殖。

嫁接：日本花柏嫁接可于晚秋或早春进行，多用侧柏作砧木。劈接、靠接、腹树均可。

采20~30年生开花结实正常的植株作采种母树。11月采收球果，日晒脱粒，净种后干藏，播种地宜选腐殖质丰富的疏松壤土，精细整地。3月间播种，播后覆土盖草。出土后分次揭草，随即搭棚遮阳。

苗期管理：在出苗达60%以上时，撤去覆草，使苗木全受光照，若不遇高温干旱，一直进行全光育苗，这样可比长期遮荫好，使苗木粗壮、根系发达、抗灾力强。苗木出齐后，要及时进行松土除草，以免杂草争水肥，促进苗木生长。第二年春移植，加强苗圃管理，定期松土、除草、施肥、清沟排渍。秋后或次年春苗高可达30cm。

一般采用休眠枝于3月扦插，插穗取自一年生的粗壮枝条，截成长10 -15cm，剪去下部枝叶，插人苗床56cm，插后充分浇水并设荫棚，保持土壤湿润，插后约100d发根，扦插时可蘸 200mg/L 911生根素，成活率较高，可达80%左右。

​日本花柏采种时应选15-30年生无病虫害的健壮母树。种子10-11月成熟，采收球果后，在晒场摊凉脱粒，经筛选，将采集到的种子装入袋中，置通风干燥处贮藏；并将干燥种子用塑料袋密封，放在木箱等容器内贮藏。

选择地势平坦，土壤肥沃、湿润、疏松的沙壤土、壤土作圃地。施足基肥后整地筑床，要精耕细作，打碎泥块，平整床面。播种季节在3月上旬到中旬。条播育苗，条距15-18厘米，播种沟内要铺上一层细土。每亩用种子4-5公斤，发芽率60%。播后要薄土覆盖，可用焦泥灰盖种，以仍能见到部分种子为宜，然后盖草。

10-15天开始发芽，待幼苗大部分出土后，揭除盖草。幼苗出土后40天内应特别注意保持苗床湿润。7-9月可每月施化肥1-2次，每亩每次施硫酸铵2-5公斤。1年生苗高10-375px以上，根径0.2-0.3cm。

也可进行扦插育苗。3-4月从幼树上剪去1-2年生侧枝，插穗长20-25cm，修去下部细枝鳞叶，扦插深度8cm，用手压紧插后50天生根，按常规进行苗圃肥水管理。2年生苗高30-40cm，根径粗0.4-0.5cm，可出苗造林。