华南木棉BBS始建于1995年秋，名定“木棉”，取热情朴实之意。开站至今，三易其版；讨论内容，则涉及工程专业技术、电脑应用、文化体育等诸多方面；系统运行，基于WWW浏览与Telnet登录之结合：文章阅读、发表和回复均可在WWW浏览器中完成，Telnet操作则更富实时对话、多人聊天、信件收发等功能，并配有文字WWW及新闻阅读等服务。早期时间在中国教育网上很有影响力，号称中国三大BBS之一，但由于某些原因（程序代码维护权限不在站务方面，而是在学校的网络中心是最主要的原因），木棉有点走下坡路，但依旧是华南地区最有影响力的BBS。

2005年3月31日，华南木棉BBS站务组接网络中心通知：华南木棉BBS将于明天（4月1日）中午12：00左右关站进行维护，恢复时间待定。由于木棉恢复后将实行实名制度，现注册帐号将不能使用，敬请各位站友务必备份自己需要的资料。

至此华南木棉BBS亦难逃脱中国高校BBS实名制改革之大势。

2008年，web2.0板木棉BBS正式上线