对于新购置的玻璃滤器，在使用前应先以热盐酸或铬硫酸进行一次抽滤，并随即用蒸馏水冲洗干净，以除去滤器中可能存在的灰尘杂质。
每次用毕或使用一定时间后，都须进行有效的洗涤处理，以免因沉淀物堵塞滤孔而影响过滤功效。对6号除菌滤器每次使用后应立即用有效洗涤液进行一次抽滤。当抽至溶液尚未滤尽前，取下该滤器浸入洗涤液中约48小时（滤片的两面均应接触溶液）。取出后用热蒸馏水抽滤冲洗，然后烘干。
各种化学洗涤液的配制可参考下表
| 沉淀物 |
有效洗涤液 |
| 脂肪。脂膏 |
四氯化碳或适当的有机溶剂 |
| 白月元。粘胶。葡萄糖 |
盐酸。热氨。5-10%碱液或热硫酸和硝酸的混合液 |
| 有机物质 |
混有重铬盐酸的温热浓硫酸或含有少量硝酸钾和高氯酸钾的浓硫酸，防止过滤 |
| 氯化亚铜。铁斑 |
混有氯酸钾的热浓盐酸 |
| 硫酸钡 |
100°C浓硫酸 |
| 泵渣 |
热浓硝酸 |
| 硫化汞 |
热工水 |
| 氯化银 |
氨或代硫酸钠的溶液 |
| 铝质和硅质残渣 |
先用2%氢氟酸用浓硫酸洗涤。立即用蒸馏水再用丙酮漂洗。重复漂洗至无酸痕为止。 |
| 细菌 |
化学纯度硫酸5.72ml，化学纯硝酸钠2.00g和蒸馏水94ml，充分混合均匀 |
