由于现代海水不能直接沉淀白云石，在常温常压条件下也不能人工合成出白云石来，所以人们普遍认为至少寒武纪以后的白云岩主要是碳酸盐沉积物或石灰岩的白云石化产物。但对前寒武纪和某些以后形成的白云岩(或白云石)以及在某些高盐泻湖中沉积的白云石的成因却有绝然不同的看法，有认为是直接的化学沉淀(包括生物化学)，也有认为是刚刚沉淀的文石立即就被交代或沉积后才被交代的。这就引出了"沉淀白云岩"、"交代白云岩"和"原生白云岩"、"次生白云岩"的争议。在沉积学中，这个问题被称为"白云岩问题"。现在这个问题还没有完全解决，即使在交代成因的白云岩中，按交代时间的早晚也有不同的成因性岩石名称，如同生(交代)白云岩、准同生(交代)白云岩、成岩(交代)白云岩等。有人把同生或准同生(交代)白云岩归于原生白云岩范畴，将浅埋成岩阶段交代的白云岩称成岩(交代)白云岩，而将沉积物固结之后才交代形成的白云岩称次生或后生(交代)白云岩。这样一些名称固然反映了人们对某些术语的不同理解，更重要的则是反映了交代白云岩也有复杂的成因。