二硫化钼是良好的固体润滑剂，广泛用于汽车工业和机械工业。不少钼化合物如钼酸、磷钼酸、钼酸铵、钼酸钠、三氧化钼等,呈白色至黄色或绿色,故可作金属电镀的着色剂或作颜料、涂料等。磷钼酸、钼酸铵、钼酸钠、三氧化钼等还可作石油工业、有机合成反应的催化剂。钼酸铵用于冶金工业中制钼条、钼丝、钼片、钼粉。钼酸铵、钼酸钠是农作物不可缺少的微量元素肥料，在工业水处理中是极好的缓蚀剂，称为钼系水质稳定剂。磷钼酸铵、二氧化钼可作催化剂，钼酸钡用于石脑油的脱硫。钼酸钙是制取钼钢、钼铁等的钼合金原料。钼酸锌可作涂料防腐剂。五氯化钼用于金属表面处理、合金焊接的助熔剂。六氟化钼是强氟化剂。
