2010年7月3日16时许，紫金山铜矿湿法厂岗位人员发现污水池的污水水位异常下降，且有废水自废水池下方的排洪涵洞流入汀江。据初步判断，是由于废水池防渗膜垫层异常扰动，导致防渗膜局部破损，废水渗透到废水池下方的排洪涵洞，流入汀江。初步统计，本次废水渗漏量为9100立方米。

紫金矿业公告表示，渗漏事故原因主要是前阶段持续强降雨，致使溶液池区域内地下水位迅速抬升，超过污水池底部标高，造成上下压力不平衡，形成剪切作用，致使污水池底垫多处开裂，从而造成污水池渗漏。

经检测，渗漏废水主要为含铜酸性废水，没有剧毒物质。福建省已成立调查组赴受污染地区开展工作，有关部门正在加强水质监测，采取措施做好善后工作。

2010年7月15日，福建省上杭县召开新闻发布会，通报紫金矿业污染事故的调查处理结果，追究有关责任人的行政和刑事责任。

7月15日，上杭县公安局依法对紫金矿业铜矿湿法厂污水渗漏污染涉嫌重大污染事故案进行立案侦查，依法对紫金矿业相关工作人员进行传唤。一些责任人员被控制，其中刑拘三人"

2010年7月18日，广东省环保厅向福建省环保厅发出特急函件，指出近日来，福建省棉花滩水库出水与广东省大埔青溪电站水体混合后铜含量明显增加，已超出渔业水质标准，对两省跨界河段产生明显影响，导致梅州境内河段渔业养殖面临较大风险。