一地震问题

历史上泉州发生过大地震,但已经是四百年前的历史了.四百年来此线位的地震已趋于平静,台湾海峡的主要地震威胁在于东岸北线和中南线.在地震方面差别并不大,旧金山金门大桥,日本明石大桥,青函隧道,意大利墨西拿大桥,等等著名跨海工程也都修建在地震带上,而且强烈活跃得多.琼州海峡,渤海海峡也发生过类似地震.

二台风问题

台海通道工程如果采用桥梁尤其是大跨悬索桥,就必须特别考虑强风问题.泉州彰化一线由于台湾高大山脉的挡风墙效应,强风影响较小,且桥隧方案中桥梁基本都采用抗风效果好的桥型.而平潭新竹是台湾海峡最著名的强风地带,非常不利于建桥,且如果在深水区建桥势必需要大跨度的悬索桥,这是最不利于抗风的桥型.

三通航问题

台湾海峡是世界黄金水道船舶,通行非常繁忙.隧道可以避免和通航的冲突但造价太高，难度太大，桥隧结合无疑是最佳解决方案。正好，台湾海峡主航道在于中线偏西，而泉州-彰化线隧道位置也正好在主航道上。其余桥梁部分通航要求很小可谓完美。

四通行问题

跨海长通道对于驾车来说存在着很大的压力和风险，通行铁路有利于人的专业化分工自动化运行，使大量驾车者得以解放速度效率。更高风险，压力更低，因此海峡通道最好是通行铁路车辆可通过列车拖挂的。