随着市场经济的发展，房屋租赁合同纠纷日益增多，尤其是一些违章建筑的租赁纠纷，有愈演愈烈的趋势。而关于违章建筑的租赁合同的效力问题，多有争论。一种观点认为违章建筑的租赁合同应该是有效的，首先，中国合同法关于租赁合同的规定并没有明确出租人应该是出租物的所有权人;其次，因为违章建筑的建造人对建筑的占有，还可以附带有使用，收益的权能，因而违章建筑人也可以把建筑物出租而获得收益。但笔者认为这种观点是不可取的。首先，虽然合同法没有明确规定租赁合同中的出租人应该是所有权人，但《城市房地产管理法》第52条却明文规定了租赁合同中出租人应该是出租物的所有权人，而且《城市房屋租赁管理办法》以及一些地方性法规也都有明文规定违章建筑不得出租。所以可以说，中国的立法例是不承认违章建筑租赁合同的效力的。其次，从占有方面来看，，按许多学者的解释，罗马法上的占有只是一种事实状态，它是"一种使人可以充分处分物的，同物的事实关系，它同时要求具备作为主人处分的实际意图。'占有'这个词的含义是指真正的掌握，一种对物的事实的控制。"[6]而德国学者耶林也认为占有不同于所有权，"所有权应由法律做出保障，占有是通过事实关系来保障的。"[7]所以说占有并不是一种权利，也不可能衍生出使用与收益的权能，从使用角度看，与前面所说的，也只是一种事实状态，是一种无权使用，与所有权之使用权能是不相同的，而所谓收益，因为没有权利依据，也是一种不当得利。综上所述，违章建筑的租赁合同因为违反法律的强制规定应该是无效的。

但就目前中国的关大农村来看，很多农村为了发展经济，积极招商引资办厂，没有经过任何规划、报批、报建，建起了大量的厂房、工棚，表面上是以厂房出资他人(多为台商、港商)合作办厂，实际上是出租厂房收取租金。从上面的缝隙来看，这样的租赁行为是非法的，不应受法律的保护。然而现实中，农村集体收入很大一部分是靠这种违章建筑出租获得的，村民的分红也就靠这一块。不幸的是很多外商赚足了钱后，有的长期拖欠租金，有的逃跑了，有的甚至留下一身债务要集体来背。这种现象目前较突出，起诉到法院，法院又无法依法保护，村民怨气大。法院处于一种两难境地。一方面，不能明知是违法建筑出租，也给予保护。另一方面，法院作为地方经济秩序与经济稳定的维护者，又不忍心看到村民受到巨大的经济损失，而且因为法院的依法办事导致村民对法院的工作的误解，是任何法院工作者所不愿看到的。对类似的案件，我们在审判实践中究竟如何处理，似乎是困扰法院的一个难题。然而从宏观的依法治国观念来看，这类问题并不难处理，法院并不是简单的地方经济的维护者，而应该是整个社会秩序的维护者。只是在处理这类问题的手段与措施上，应该灵活、机动，应该对当事人晓之以礼、动之以情。另一方面，依法办案对于遏制当前农村正盛的违章建筑之风也是有很大好处的。