2006年06月28日上午9时，武汉首个地下车站在武昌火车站动建，该车站将建设在地下。它也是与武昌火车站改造配套的项目，二者同步进行。
武汉地铁集团称，最早有两个地下车站开工，分别位于武昌火车站、武汉火车站。这两个地铁站是武汉地铁4号线一期工程的首站和末站，投资总额为3.02亿，武昌火车站处的地铁站先开工。武汉市地铁有限公司有关人士称，武汉地铁4号线的主要功能之一就是解决乘客在两大火车站间的换乘。乘客不出火车站站区，就可换乘地铁，大约仅半小时后即可抵达另一火车站。
武汉地铁2号线，是武汉市首条开工建设的地铁线路，也是全国第一条跨越长
江的地铁。一期工程试验段于2006年11月16日正式动工。
据了解，过江地铁是国内外城市轨道交通中，第一个穿越强冲刷水域的，地质条件非常复杂，沿线有大量历史建筑要保护。据测算，位于长江江底的地铁长度达3公里，如何通风，灾害时如何安全防护、疏散，都是大难题，以前没碰到过。普通地铁的类似问题，解决起来要相对容易多了。江南、江北的地铁出口，往江底走坡度很大，车辆上下如何稳定安全，难度属全国第一。专家们说，武汉过江地铁还有一项全国第一，即首次对反恐防爆炸进行安全论证。
武汉市首段地铁盾构区间隧道--汉口范湖至汉口火车站区间2008年12月30日凌晨2时许贯通。
汉范区间为武汉地铁2号线首段盾构区间，全长1.01公里，为双洞双线设计，直径6.28米，只有约长江隧道直径(11.38米)的一半。武汉首台地铁盾构机"开拓者十号"在地下约16米深处掘进103天后，终于"重见天日"。武汉地铁集团介绍，由于发展大道规划建二环线下穿通道，为了不影响今后该通道的施工，施工单位在临近终点时放慢了掘进速度，专门对地铁隧道与下穿通道交叉部位的地基进行了加固。汉口火车站广场的接收井处已经打好了14口降水井，这些深达14.5米的降水井用来降低地下水位，保证盾构机安全出洞。
2009年12月18日，武汉地铁2号线一期虎泉站至名都站区间隧道成功贯通，这是武汉地铁首条采用矿山法施工贯通的区间隧道，也是继2009年6月20日汉口火车站站至范湖站盾构施工区间隧道双向贯通后，长江南岸首条双向贯通的区间隧道。
虎名区间隧道分左右双线，总长2503m，采用矿山法施工。该区间隧道地质复杂，洞顶为滞水发育的浅埋覆盖层，其中人工杂土超浅埋洞段长达680m，粘土层最薄处厚度仅0.5m，洞底岩溶、溶沟及溶槽发育，施工难度极大。
虎名区间于2008年08月19日开工建设，参建各方高度重视工程的质量安全，精心组织，密切配合，科学调度，不断优化施工方案，克服了高水位区断层带、溶洞重灾区、侵入基岩无声爆破开挖、人工杂填土超浅埋段等诸多困难，有效预防了突水、突泥、地表沉陷、管网毁损等安全风险，实现了区间隧道安全顺利贯通。
2010年2月4日，2号线首条联络通道顺利贯通，这是武汉地区首次采用冷冻法施工获得成功的工程。该通道位于武汉地铁2号线汉口火车站站至范湖站区间隧道的正中间，将左右线隧道连接起来，长约6米，净高5米，净宽3米多。该通道分两层，下层可抽排隧道内积水;上层为乘客逃生通道。地铁2号线全线将设多处联络通道。
武汉地铁2号线金色雅园站至常青花园站左线区间隧道轨道于2011年7月22日铺通，成为2号线完成铺轨的首段区间隧道。
该区间隧道单线长1.7公里，地铁隧道内的温度比地面低10多摄氏度，冬暖夏凉。两排钢轨延伸至隧道尽头，钢轨之间的道床上有一个水沟，可将隧道内的渍水搜集到隧道中段的积水井，然后用水泵抽至隧道外的市政排水管网。由于隧道内有施工人员作业，轨道车限速5公里/小时，跑完单程耗时约20分钟。汪林说:"等地铁通了，这段隧道两分钟左右就跑完了。" 地铁2号线轨道与高铁轨道的技术要求是一样的，但地铁轨道对减震降噪的要求高于高铁。
经过中铁隧道集团22个月的艰苦攻关，2011年8月6日早晨6时，被誉为"万里长江地铁第一隧"的武汉轨道2号线右线顺利贯通，成为中国第一条穿越长江的地铁隧道。地铁2号线隧道位于武汉长江大桥和武汉长江隧道之间，全长约3100米，开挖深度在长江平均水位线下48米处，为双线双洞隧道。武汉地铁2号线右线从积玉桥站出发，在江汉路的地下25米处停下。
2013年11月7日下午3点，在地铁2号线光谷广场站C出入口旁，一个占地约130平方米的售票厅投入使用，这是武汉地铁第一个地面售票厅。
2016年3月28日随着武汉地铁6号线首列车到武汉，也是首列A型车到达武汉，标志着武汉进入大运量地铁时代。
2016年8月31日上午，随着武汉轨道交通6号线第23列"鹦鹉绿"新车到汉，武汉地铁迎来第1000辆列车的到来。
2013年3月8日
三八妇女节，总客流刷新至80.6万人次。
2013年5月~9月
五一劳动节，总客流刷新至85.9万人次;中秋节刷新至87.2万人次。
2013年9月30日
国庆前夕，总客流又刷新至95.98万人次。
2013年12月24日
平安夜，全线网首次突破100万人次客流，达108.29万人次。
2014年4月4日
线网日客运量突破120万人次，达122.7万人次。
2014年9月30日
国庆前夕，地铁客流136.2万人次创纪录。
2014年12月24日
平安夜，总客流137.9万人次创纪录。
2014年12月31日
元旦前夕，客运量突破150万，达155.72万人次。
2015年3月21日
总客流157.73万人次创纪录。
2015年4月30日
五一前夕，客运量再创新高为161.03万人次。
2015年9月30日
客流量达到195万人次
2015年12月31日
截至21时，出行量已达224.3万人次，且仍在继续攀升，首破200万人次
2016年4月1日
清明节，武汉城市轨道交通线网客运量(含换乘)为254.19万人次
2016年12月24日
平安夜，总客流量刷新至263.1万人次
2016年12月31日
客运量突破300万人次，达302.41万人次
