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主干上承树冠,下接根系,是地上部与地下部养分与水分交流的运输总通道。主干的高度对根系的生长、树冠的形成以及进入盛产期的迟早有着密切的关系。矮干是当前果树整形的趋向,因矮干缩短了根系与树冠的距离,加速了养分与水分的交流运转,有利于根系的生长与树冠的形成。但主干过矮容易造成枝叶垂地,影响农事操作。柚的主干高度比其他柑橘类略高些,一般以40~50厘米为宜。