种子繁殖法即有性繁殖法，就是利用雌雄受粉相交而结成种子来繁殖后代，一般繁殖多用此法，不仅有大量种子产生可以繁殖较多的新苗。
种子繁殖的紫檀树实生苗，根系发达，抗风力强，枝繁叶茂，生机形态多姿，并能随着树的逐年生长成材，但这种树一般都要种植十多年后才开花结果。
剪取花卉的、茎、叶插入苗床中，使其生长为一棵完整的植株，这种方式叫扦插。用作扦插的材料（根、茎、叶），叫做插穗。
扦插繁殖的紫檀树，优点是枝条来得容易，价格便宜，解决了绿化的燃眉之急。缺点是其根系是向四周平展生长，无法形成垂直向下长的主根，由此抗风力差，为了防台风，每年都要将部分或全部枝条砍下变成秃顶断头树，年复一年地砍伐枝条，既影响了树的生长，也影响了树形树貌。同时也难长出有价值的心材（格），要想取得紫檀树心材，必须用种子繁殖。
