根结线虫病
危害症状：该病主要危害根部。侧根和须根被侵染后，形成许多大小不等的根瘤；须根减少、根毛稀少、根尖肿大。根瘤初呈黄白色，后逐渐变成褐色，最终腐烂。根系受害较轻时，病株地上部无明显症状；受害加重时，地上部表现枝梢短弱，叶片变小，长势衰退，如缺肥状；受害严重时，叶片发黄，无光泽，叶缘卷曲，如缺水状，最后叶片干枯脱落，枝条枯萎，甚至全株枯死。此外，重病株还常表现开花多、挂果率低，果实小，叶片呈缺素花叶。主要侵染来源是病苗、携带线虫的水源、基质和病株残根。日平均气温20-30℃时有利此病传播，一年发生多代，可重复侵染。此病在各种栽培基质中都会发生，一般在通气良好的栽培基质中发病较为严重。几乎所有的栽培品种皆可感病，新种植花农往往未注意防治该病，等到该病发生，为时已晚，造成损失10-30%，个别种植园损失高达50%以上，是众多花农不敢种植的主要原因之一。
防治方法：
①培育无病苗选择不带病原线虫的地块建圃并使用不带病原线虫的水源。
②曝晒栽培基质并按每立方米栽培基质用3%呋喃丹颗粒剂200克、或3%米乐尔200克、或10%克线磷颗粒剂200克拌匀后覆盖塑料薄膜堆闷10-15天后种植。
③在摆放盆栽朱砂根前进行土壤消毒，每亩撒施3%呋喃丹4-5千克、或10%灭线磷4-5千克或3%米乐尔4-5千克。
④拔除病死株连同栽培基质一起销毁，并及时施用下列药剂：3%呋喃丹600倍液，或10%灭线磷600倍液、或1.8%阿维菌素800倍液等。连续施药2次（隔15天施药1次）。以后冬春季每2个月施药1次，夏秋季每月施药1次。
茎腐病
危害症状：在朱砂根的培育过程中均会感茎腐病，苗期尤为严重。发病初期地上部生长不良，茎基皮层外部无明显病变，尔后茎基皮层逐渐变为浅褐色至黑褐色，病部失水干缩，纵剖病基部，可见木质部呈暗褐色。病部以上叶片发黄萎蔫，后变为黄褐色并枯死。叶片多残留在株枝上不脱落，根部及根系不腐烂。病菌借助水流、农具传播蔓延。温度20℃左右及高湿条件，利于发病。
防治方法：
①选择地势较高、排水良好的地块种植，并做好基质消毒。
②及时进行药剂防治：选用2.5%悬浮种衣剂——适乐时1200倍液、或高锰酸钾600倍液、或75%百菌清可湿性粉剂600倍液、或40%拌种双粉剂800倍液，喷于茎基部，连喷2次，隔7天防治1次。也可用40%五氯硝基苯粉剂200倍液加福美双200倍液涂抹发病茎基部。
疫病
危害症状：早疫病主要危害叶片、叶柄、茎秆，幼苗期至成株期均可发病。叶片受害初期出现针尖大小的黑褐色圆形斑点，逐渐扩大成圆形或不规则形病斑，有明显的同心轮纹，病斑周围有黄绿色晕圈，潮湿时病斑上长有黑色霉层。茎及叶柄上病斑为椭圆形或棱形，黑褐色，多产生于分枝处。发病后期，茎基部病斑绕茎一周，植株枯死。晚疫病主要危害叶片、茎和果实。病株叶片出现暗绿色水渍状病斑，空气湿度大时，病斑边缘产生稀疏的白色霉层，病斑扩大后，叶片逐渐枯死，叶柄处腐烂。茎和叶柄的病斑为水渍状，褐色凹陷，最后变为黑褐色，逐渐腐烂，植株萎蔫。病菌来源于种子或栽培基质，通过风、雨、水传播。无塑料薄膜大棚栽培，高温高湿，旬降雨量在100毫米以上，日降雨量在50毫米以上，有利疫病发生。
防治方法：
①选用抗病品种。在8月份开花结果的品种抗病力较强。
②发病初期喷施30%爱苗乳油1000倍液、或42%巴氏疫病1000倍液、或72%杜邦克露可湿性粉剂600倍液或69%安克锰锌900倍液、或50%扑海因可湿性粉剂600倍液、或70%疫佳可湿性粉剂600倍液，用后5种药剂应连续轮流喷施2-3次，隔7天防治1次。
根腐病
危害症状：发病初期，植株叶片自下而上在中午前后萎蔫，早晚尚可恢复，几天后，整株枯死，叶枝果不脱落，呈青枯状，根部细根腐烂,向主根蔓延。病菌借助雨水或水流传播蔓延，早春和初夏阴雨连绵，高温高湿，昼暖夜凉的天气有利发病。新植或新换盆，地下害虫危害加重病情。
防治方法：发病初期浇灌50%根腐灵800倍液、或50%杀菌王水溶性粉剂1000倍液、或50%地灵可湿性粉剂800倍液等。连续施药2次，隔7天防治1次。对新植或新换盆的植株，当天或第2天施药1次预防效果最佳。
蚜虫
危害症状：成虫和若虫刺吸嫩叶、嫩茎汁液，使叶片卷缩发黄，严重时影响生长、造成落果。在晴天少雨季节危害尤为严重。
防治方法：50%抗蚜威可湿性粉剂2000-3000倍液、或50%灭蚜松乳油2500倍液、或10%蚜虱净可湿性粉剂4000倍液、或15%哒螨灵乳油2500倍液、或2.5%功夫乳油（除虫菊脂）3000倍液。
甜菜夜蛾和斜纹夜蛾
危害症状：以幼虫为害叶片造成缺刻和孔洞，影响生长，观赏价值降低。
防治方法：
①清洁田园，清除杂草、残枝、落叶予以深埋或烧毁，减少虫源。
②花圃上及四周拉好遮阳网,防止成虫迁飞产卵。
③用杀虫灯诱杀成虫，减少卵量,降低虫口密度。
④防治药剂：20%灭扫利乳油1500倍液、或48%乐斯本乳油2000倍液、或20%绿色辛硫磷1000倍液、或50%甲基1605乳油500倍液、或25%杀铃丰2000倍液。
