FSSS系统一般分为两个部分，即燃烧器控制系统BCS（Burner Control System）和燃料安全系统FSS(Fuel Safety System)。燃烧器控制系统的功能是对锅炉燃烧系统设备进行监视和控制，保证点火器，油枪和磨煤机组系统的安全启动、停止和运行。燃料安全系统的功能是在锅炉点火前和跳闸停炉后对炉膛进行吹扫，防止可燃物在炉膛堆积。在检测到危及设备、人身安全的运行工况时，启动主燃料跳闸（MFT），迅速切断燃料，紧急停炉。
以某600MW亚临界机组为例——
该600MW火电机组锅炉为的亚临界，一次再热，自然循环汽包炉，配有6台MPS-89G型磨煤机，每台磨煤机配一台给煤机；共36个煤粉燃烧器，前后墙对冲布置三层，每层六个；每个燃烧器配置一个CFS点火油枪；在底层与煤燃烧器同时布置12个油燃烧器，油燃烧器和点火油枪全部投入可带30%负荷；点火油枪采用高能点火器HEI引燃。火焰检测采用单燃烧器检测，每个燃烧器配有两个火焰监测器。针对机组实际情况，其安全监控仿真系统的逻辑功能主要包括以下几个方面：炉膛吹扫，主燃料跳闸，燃烧器系统控制。其中逻辑程序是根据B&W逻辑图为基础，同时参照实际运行中的现实情况，经过相应的修改，从而实现的。
FSSS的逻辑控制中的一个核心问题是通过周密的安全连锁和许可条件，防止可燃性混和物在炉膛煤粉管道和燃烧器中积存，以防止炉膛爆炸产生。因此，炉膛吹扫是安全运行的必要措施。FSSS的吹扫控制功能主要是在吹扫前对锅炉的有关设备进行安全性检查，在满足全部吹扫许可条件后，开始进行吹扫。吹扫时，切断所有进入炉膛的燃料输入，吹扫空气流量大于30%且小于40%额定风量，吹扫时间不少于5分钟。
主燃料跳闸（MFT）是FSSS系统中最重要的安全功能，当出现任何危及锅炉安全运行的危险工况时，MFT动作将快速切断所有进入炉膛的燃料，即切断所有煤和油的输入，实现紧急停炉，汽机跳闸，以保证设备安全，避免重大事故发生。同时，该逻辑中具有首次跳闸原因指示功能，它能对引起主燃料跳闸的最初原因记忆并在CRT上显示出来，为故障原因分析及解决提供了条件。
当出现下列任一种情况时，会引发MFT：二台送风机全停；二台引风机全停；二次风母管压力高（大于2.8 kPa，三取二，延时2秒），RB延时5秒；二次风母管压力高高（大于3.5 kPa，三取二，延时5秒），且联跳送风机；锅炉总风量小于25%(547t/h)，延时2秒；汽包水位高高（大于 203.2 mm，水位变送器三取二，延时20秒），RB延时60秒；汽包水位低低（小于－228.6 mm，水位变送器三取二，延时20秒) ，RB延时60秒；炉膛压力高（大于 1.25 kPa ，三取二，延时2秒），RB延时5秒；炉膛压力低（小于－1.75 kPa，三取二，延时2秒），RB延时5秒；炉膛压力高（大于 2.5 kPa，三取二，延时5秒），且联跳送风机；燃料失去；再热器遮断(任一条件满足时)：1）主汽流量>300t/h时汽机跳闸；2）主汽流量≤300t/h，发电机已并网达60秒且旁路未投，汽机跳闸，延时60秒；3）发电机未并网且旁路未投，投用油枪数超限（注：#1机为油枪>24）；汽机跳闸，延时90秒；手动MFT。MFT后，会引发一系列的设备跳闸和关闭，从而实现保护功能。
燃烧器系统包括煤、油燃烧器和点火油系统。 点火油系统包括点火油母管、点火油枪组。FSSS系统控制其启动、停止和跳闸。600MW机组的每台燃烧器配置一个点火油枪，共36支。点火油枪以组为单位投入运行，每层六个点火油枪的1、3、5分为一组，2、4、6分为一组分别来控制。在满足点火油枪组启动许可条件后，就可以发出启动信号。具体启动过程为：点火油枪推进－打开雾化蒸汽阀－高能点火器打火－开油阀；停止顺序是：高能点火器打火－关闭油阀－打开吹扫阀－关闭雾化蒸汽阀－120秒后打开雾化蒸汽阀－点火油枪退回，关闭雾化蒸汽阀。 FSSS系统控制包括油燃烧器母管、油燃烧器组和油燃烧器在内的油燃烧器系统的启动、停止和跳闸。其中油燃烧器的母管控制包括油燃烧器母管跳闸阀和再循环阀的控制。油燃烧器的投运和停止也是以组为单位进行的，1、3、5分为一组，2、4、6分为一组。当油燃烧器启动许可条件满足即吹扫结束，MFT复归后，就可以推进油枪，打开雾化蒸汽阀、冷却风阀以及进油电磁阀。
主燃料系统，即制粉系统，包括磨煤机、给煤机、一次风机、润滑油泵及相关阀门的启动、停止、跳闸及隔离、充惰、清扫过程也均有FSSS系统逻辑控制。这些设备的运行可由运行人员通过CRT进行操作，整个磨组设备也可由磨组的自动顺序启停来控制。磨组的启停是燃料系统中重要的一环，对于600MW机组，共6台磨煤机，每台磨煤机与相应的给煤机等其他配套设施构成一个磨组，独立控制。
