浙江大学水文与水资源工程研究所具有较强的研究基础及较厚的实力之外，还拥有良好的实验室设备，包括大型高性能服务器、并行机、自动气象站、土壤湿度、温度、径流计、声学多普勒流速剖面仪ADCP、GPS、液相色谱、气相色谱、离子色谱、原子吸收、TOC分析仪、紫外和红外分光光度计等各种室内、便携式的现场监测仪器。同时，研究所拥有完善的水资源、水环境、GIS等专业实验室，并配有地质水文学计算模拟平台、MIKE 11和Delft3D等专门水资源与水环境分析软件，ArcGIS地理信息系统软件、PRECIS区域气候模式。
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