粉黛睡莲是多年水生草本;根状茎短粗。叶纸质,心状卵形或卵状椭圆形,叶表绿色,新叶铜紫色;叶背紫褐色。叶长大于叶宽,叶裂近完全重叠于叶基。叶径30×28厘米,叶展1.5米。叶柄紫色,具绒毛。
花朵内轮花瓣粉红色,密布斑点;外轮颜色稍浅,密布斑点。萼片带白色,向基部逐渐变为粉色。花药黄色,雄蕊橙色,外轮粉色。花牡丹型,直径15-18厘米,具宜人的芳香,在新开的花朵中尤其明显。花瓣数24-25,萼片数4。花梗紫色,具绒毛。
浆果球形,直径2-2.5厘米,为宿存萼片包裹;种子椭圆形,长2-3毫米,黑色。花期6-8月,果期8-10月。