但是电渗析有个很大的缺点，就是操作复杂，而且设备极易损坏。在两个极水室里容易形成垢。所以必须每隔一段时间进行一次倒极，这样原来的浓水室变成淡水室，原来的淡水室变成浓水室。
混和离子交换除盐虽然看已达到较好的水质要求，但是交换树脂必须定期再生，再生时产生了酸碱损耗，并且产生污染，增加水耗。混和树脂还一直存在再生时分层不清的技术困难，虽然有很多方法可以解决，但是效果都不佳。
而连续电除盐技术，则是将这两种方法相结合。在电渗析的每隔一个室里装上混和离子交换树脂，这样，在电除盐的同时也进行离子交换，并且还有混合离子交混树脂便边交换边再生的优势，无须酸碱再生，大大减少了污染节约了运行成本。
