实行由广东省地方税务局和河源市委、市政府的双重领导，以省局领导为主的管理体制。目前，内设10个职能科室：办公室、法规科、税政科、规费管理科、征收管理科、计划财务科、信息管理科、人事教育科、机关党委办公室和监察室，有稽查局、高新区局和源城区局3个直属行政单位和纳税人服务中心、机关服务中心2个事业单位，5个全职能县地方税务局，33个基层税务分局。截至2010年底，全系统共有在编干部职工908人。全市地税系统负责管理的税种有：营业税、企业所得税、个人所得税、资源税、城市维护建设税、土地增值税、印花税、房产税、城镇土地使用税、车船税、契税和耕地占用税等。同时负责征收社保费、教育费附加、文化建设事业费、残疾人就业保障金、堤围防护费等。
