由于注册会计师对会计估计的审计是作为整个会计报表审计的一个有机组成部分而进行的，所以注册会计师可以结合会计报表的其他有关项目进行审计。对于不同类型的会计估计事项，注册会计师所采取的审计程序也是各不相同的，但总结起来，对会计估计进行审计的一般程序主要包括以下几个步骤：

1、向被审计单位管理部门询问，初步了解管理部门用于确定、评价与控制会计估计事项的有关方针政策和工作程序，包括对有关这类程序和方法的控制环境的了解，以便能够确定这些程序和方法的合理性。

2、对企业会计估计所依据的数据与假定进行检查和研究。注册会计师在初步了解管理部门有关会计估计事项的方针政策和工作程序以后，应该对企业会计估计所依据的数据与假定进行检查和研究，主要包括以下几个方面：

1）注册会计师应当对会计估计所依据的数据的准确性、完整性和相关性获得合理的确信。

对于进行会计估计所使用的会计数据，应当与通过会计制度处理过的数据相一致，例如，在证实被审计单位预提的产品担保修理费用时，注册会计师应当考虑企业对产品的保修期限，并对企业有关的产品已经售出但在资产负债表日仍然处于保修期内的数据与会计制度内的销售资料的一致性获得合理的确信同时注册会计师应当考虑企业产品质量的变化，对已经售出产品需要维修的可能性作出相应的估计。

2）注册会计师还可以通过被审计单位外部的资料来证明会计估计的合理性。例如。当对逐渐废弃的存货参照未来的交易额计提的存货变现损失准备进行检查时。注册会计师可以通过检查诸如过去的销售水平、现有的订单和市场趋势等内部数据以及行业产品销售预测和市场分析方面证明被审计单位的会计估计情况。

3）注册会计师应当明确，管理部门已经确保为进行会计估计而收集的数据资料是作了适当分析的，并且这些数据资料可以作为相应的会计估计的合理基础。例如，对应收账款的账龄分析，是根据过去应收账款的入账时的情况等资料所进行的分析，如果被审计单位对这种分析已经可以通过计算机来进行处理，那么注册会计师应当确保所运用的审计程序的适当性。这种审计程序可以包括计算机测试程序和运用计算机辅助审计程序。

4）注册会计师还应当研究被审计单位用于会计估计的主要假定是否有充分的基础。在某些情况下，这些假定可以依据行业或政府的统计资料来确定，例如，未来的通货膨胀率、利率、就业率和预测的市场发展情况。注册会计师在对会计估计所依据的假定进行评价时，应当考虑以下内容：与以前会计期间的实际结果相比是否合理；与那些已经作出的其他有关的会计估计是否一致；与管理部门的那些看来是合理的计划是否一致。

5）对管理部门用于进行会计估计的公式。注册会计师应当检查其连续的适当性。这种检查应当考虑到注册会计师对被审计单位以前期间财务结果的了解、在本行业中其他单位使用此公式的实务以及管理部门向注册会计师揭示的未来计划。

6）注册会计师应当考虑是否有任何重大的期后事项，以便能够确定会计估计的合理性或者其对用于会计估计的数据和假定的影响。

3、对会计估计计算和披露的检查。注册会计师应当测试由管理部门运用的计算程序，对于测试范围将依据在确定这些会计估计所包含的复杂性、对单位在估计中运用的程序和方法的评价以及这种估计在财务资料前后关系中的重要性而确定。

按照对管理部门的计算程序测试的可选择性，注册会计师可以通过其以不同方式所编制的会计估计评价管理部门的估计结果。同时注册会计师还要检查被审计单位的会计估计是否按照企业会计准则的要求对企业的会计估计事项进行充分合理的披露。

4、将前期的会计估计结果与该事项的实际结果进行比较。注册会计师将企业前期的会计估计结果与该事项的实际结果进行比较，借以获得被审计单位的会计估计程序是否可靠的证据。通过比较，注册会计师应当明确会计估计公式需要进行调整之处并计算本期实际结果和前期估计两者之间的差异数额，必要时，可以提请被审计单位采取适当的会计处理措施。

5、评价审计结果，得出审计结论。注册会计师应当确定关于会计估计假定的适当性和计算的准确性是否已经得到合理的确信。而且还应当根据本人对被审计单位及其所在行业的了解，以及与在审计期间得到的其他证据的一致性程度。确定这些会计估计的合理性。

当注册会计师能以适当的证据证明某一事项的估计数据与包括在会计报表中的估计数据之间存在差异时，注册会计师必须获得充分适当的审计证据，以确定这种差异是否已经构成了错误。如果这种差异是企业会计报表的可容忍误差，那么它就是合理的，而不是一种错误。但是，如果注册会计师认为这种差异是不合理的，他应当要求管理部门将这些会计估计改正到可容许的数额。如果管理部门拒绝修改这些会计估计，那么这些会计估计和最接近合理的会计估计之间的差异，应当被认为是一种错误。注册会计师应考虑这些错误的重要性以及其对会计报表的影响，继而发表恰当的审计意见。此外，注册会计师还应注意，其所容许的合理的个别差异对企业整个会计报表的累积影响。在这种情况下，注册会计师应重新考虑所采用的整个会计估计的合理性和适当性。

当注册会计师对会计估计的适当性不能获得合理的确信，也不能获得审计证据来证明其他的会计估计事项时，他应当考虑是否在审计范围上存在着限制。如果是这样，那么注册会计师应当根据会计估计事项对企业会计报表影响程度的大小，提出保留意见、否定意见或拒绝表示意见的审计报告。