局机关设政秘处、施工管理处、水电管理处和企业管理处4个副处级建制和财务科1个科级建制职能机构。现有在职职工51人，其中专业技术人员47人。下设安徽省水利水电建设经济定额站和安徽省水利水电职业技能鉴定站。省水利厅安全生产委员会办公室挂靠基建局。承担安徽省水利水电行业协会日常工作。1995年以来，先后创办了安徽省水利水电工程建设监理中心（水利部甲级资质）、安徽省水利水电工程招标代理中心（建设部甲级资质）、安徽省水电技术开发服务中心和安徽省明珠水电开发有限责任公司等4个直属国有企业。2003年6月，经省政府批准，省水利厅由基建局为主抽调人员组建了安徽省水电有限责任公司。

为加强全省水利水电工程建设与管理，积极推行项目法人、招标投标和建设监理等三项制度改革，先后拟定并颁布实施了《安徽省水利工程建设管理办法》、《安徽省水电工程招标投标实施细则》、《安徽省水利工程建设监理管理办法》、《安徽省水利工程建设分级管理办法》等一系列规范性文件和标准，对规范全省水利水电工程建设管理起到了重要作用。

在加强水利基础实施建设管理方面，先后组织建设了包浍河初步治理工程、怀洪新河枢纽建筑物工程、寿西淮堤退建和城西湖退水闸工程。目前，上述工程已全部通过竣工验收。其中，胡洼闸、固镇闸、何巷闸、西坝口闸等工程荣获安徽省优质工程奖——“黄山杯”。2001年以来，作为项目法人、现场管理机构以及责任单位，先后承担了临淮岗洪水控制工程四项主体工程，城西湖蓄洪堤下段加固工程，佛子岭、磨子潭水库除险加固工程，瓦埠湖治理东淝河下段整治工程，淮河干流黑龙潭段河道疏浚工程，安徽省东淝闸加固与扩建工程和姜唐湖蓄（行）洪区堤防加固工程等多项重点工程建设任务。

近年来，全省先后建成8个初级水电农村电气化县，完成小水电站装机1262台47.72万KW，已成为全省30多个山区县稳定、可靠的经济支柱，对促进山区群众脱贫致富、改善生态环境、发展山区经济发挥了不可替代的作用。

遵循“献身、负责、求实”的理念，我局将积极调整思路，进一步转变职能，逐步从计划经济时代的行政管理职能转变为政府与市场之间的桥梁和纽带，以新的思想、新的姿态、新的干劲，再启新的航程，为安徽水利事业再创辉煌而奋斗。